95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0999 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  46.93 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  35.31 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  36.25 
 
 		 327 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  36.64 
 
 		 343 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  35.62 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  37.39 
 
 		 329 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  35.62 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  36.01 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  35.6 
 
 		 344 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  35.69 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  35.37 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  35.26 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  35.26 
 
 		 355 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  39.06 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  31.2 
 
 		 843 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 333 aa  125  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 358 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  32.42 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 367 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  33.62 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  31.79 
 
 		 348 aa  95.9  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 368 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  29.97 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  29.57 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 369 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  27.44 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  29.56 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.13 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  24.13 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  27.47 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.75 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  25.08 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  26.65 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  25.06 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  22.22 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  25.7 
 
 		 523 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  38.89 
 
 		 462 aa  50.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  55.81 
 
 		 349 aa  45.8  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  31.51 
 
 		 647 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  39.68 
 
 		 495 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  31.51 
 
 		 647 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  28.95 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  28.95 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  53.85 
 
 		 465 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  35.19 
 
 		 645 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.9 
 
 		 674 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  47.17 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  53.85 
 
 		 465 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  37.1 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  27.42 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  44.64 
 
 		 474 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.76 
 
 		 674 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  32.58 
 
 		 471 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  53.85 
 
 		 659 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  41.27 
 
 		 472 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 494 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  32.22 
 
 		 468 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  41.82 
 
 		 478 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  52.63 
 
 		 491 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1245  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 350 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  41.82 
 
 		 478 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  52.63 
 
 		 491 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  45.45 
 
 		 503 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  47.62 
 
 		 373 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  26.49 
 
 		 404 aa  42.7  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  51.28 
 
 		 428 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  52.63 
 
 		 493 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  28.76 
 
 		 468 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  53.85 
 
 		 659 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  32.22 
 
 		 469 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>