267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0013 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
475 aa  939    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  30.8 
 
 
458 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  28.4 
 
 
480 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 
477 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  28.51 
 
 
477 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  27.09 
 
 
525 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  25.75 
 
 
464 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  24.44 
 
 
531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  26.45 
 
 
464 aa  128  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  24.22 
 
 
541 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  24.25 
 
 
471 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 
486 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 
463 aa  124  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  26.36 
 
 
456 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  23.74 
 
 
482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
482 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  25.55 
 
 
583 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  27.82 
 
 
647 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  25.49 
 
 
489 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  24.02 
 
 
547 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  24.36 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  24.21 
 
 
547 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  24.02 
 
 
547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  23.9 
 
 
547 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  24.21 
 
 
547 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  24.02 
 
 
547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  24.21 
 
 
547 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  24.21 
 
 
547 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  24.21 
 
 
547 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  29.6 
 
 
541 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  25.19 
 
 
631 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  27.91 
 
 
539 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  24.58 
 
 
459 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  25.52 
 
 
457 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.57 
 
 
457 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
549 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 
537 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  23.8 
 
 
429 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  24.1 
 
 
458 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.64 
 
 
649 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.64 
 
 
649 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  23.84 
 
 
548 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  22.77 
 
 
475 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  23.55 
 
 
463 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  23.49 
 
 
457 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  27.6 
 
 
640 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  21.41 
 
 
457 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 
642 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  25.91 
 
 
652 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  24.85 
 
 
627 aa  100  6e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 
637 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.65 
 
 
554 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  24.86 
 
 
660 aa  97.8  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  26.65 
 
 
554 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  23.89 
 
 
458 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  26.65 
 
 
554 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
658 aa  97.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  23.81 
 
 
631 aa  97.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  26.77 
 
 
683 aa  96.7  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 
638 aa  96.3  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  23.97 
 
 
457 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  27.64 
 
 
645 aa  95.1  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  26.9 
 
 
553 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  26.9 
 
 
553 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  26.9 
 
 
553 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  26.9 
 
 
553 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  24.91 
 
 
519 aa  95.1  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  26.9 
 
 
553 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  23.95 
 
 
623 aa  94.4  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  27.3 
 
 
685 aa  94  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  24.5 
 
 
846 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  24.38 
 
 
644 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  27.31 
 
 
657 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  25.57 
 
 
646 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  24.38 
 
 
1363 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2513  flagellar hook-associated protein FlgK  21.17 
 
 
469 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00819132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  24.12 
 
 
457 aa  90.9  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 
1363 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
715 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  23.4 
 
 
640 aa  90.1  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 
453 aa  90.1  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  24.65 
 
 
482 aa  90.1  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  26.4 
 
 
698 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  23.32 
 
 
484 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  24.5 
 
 
847 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  26.59 
 
 
702 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 
546 aa  89.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  22.4 
 
 
624 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  22.4 
 
 
624 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  24.37 
 
 
622 aa  89  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  27.31 
 
 
657 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2609  flagellar hook-associated protein FlgK  21.81 
 
 
469 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0376926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  23.74 
 
 
688 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  21.75 
 
 
457 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  25.23 
 
 
623 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  26.45 
 
 
690 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  23.24 
 
 
838 aa  88.2  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  28.63 
 
 
665 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>