193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0040 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 276 aa  543  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  32.59 
 
 		 285 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  31.86 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  35.27 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  27.55 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.2 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  24.34 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  27.41 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.01 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  26.19 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  25.69 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  23.69 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 288 aa  72  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  25.69 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  24.82 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  27.47 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  26.02 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  21.05 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  23.38 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  23.72 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  22.1 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  20.76 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  23.22 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  23.22 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  23.02 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  25.58 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  23.65 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  21.59 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  26.05 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  26.05 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  20.44 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  24.4 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  24.71 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  24.28 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  24.57 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  24.57 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  21.33 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  24.07 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  23.05 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  26.36 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  26.44 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  22.99 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  22.3 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  23.93 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  23.18 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  27.12 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  26.5 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  20.54 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  22.49 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  23.53 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  23.91 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  23.58 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  24.52 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  23.2 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 		 357 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  24.31 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  24.52 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>