More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1948 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  79.49 
 
 		 442 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  86.27 
 
 		 437 aa  768    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 		 437 aa  868    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  86.96 
 
 		 441 aa  753    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  85.98 
 
 		 440 aa  765    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  85.75 
 
 		 440 aa  763    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  85.98 
 
 		 440 aa  765    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  85.29 
 
 		 440 aa  757    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  78.16 
 
 		 437 aa  699    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  80.8 
 
 		 438 aa  684    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  86.04 
 
 		 437 aa  768    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  86.04 
 
 		 437 aa  768    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  78.8 
 
 		 436 aa  702    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  81.16 
 
 		 436 aa  717    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  76.73 
 
 		 439 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  80.65 
 
 		 436 aa  720    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  60.32 
 
 		 445 aa  531  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  60.23 
 
 		 449 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  60.91 
 
 		 434 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  59.67 
 
 		 433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  58.74 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  59.3 
 
 		 447 aa  512  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  58.74 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  59.33 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  48.5 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  48.96 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  51.68 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  49.31 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  49.17 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  48 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  49.75 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  50 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50.25 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  45.93 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  50 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  50.12 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  50.25 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  50 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  46.19 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  50.25 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  50 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  46.44 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  46.44 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  46.44 
 
 		 440 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  46.29 
 
 		 409 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  46.08 
 
 		 444 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  46.08 
 
 		 444 aa  362  9e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  45.83 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  46.08 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  45 
 
 		 425 aa  361  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  48.76 
 
 		 411 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  46.19 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  45.95 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  45.97 
 
 		 409 aa  352  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  45.21 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  44.58 
 
 		 430 aa  350  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  44.96 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  45.6 
 
 		 417 aa  336  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  45.31 
 
 		 410 aa  336  5.999999999999999e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  43.54 
 
 		 402 aa  317  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  40.9 
 
 		 451 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  42.4 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  39.33 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  40.19 
 
 		 413 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  42.69 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  39.26 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  41.27 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  41.91 
 
 		 424 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  41.5 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  41.38 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  40.62 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  43.77 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  40.58 
 
 		 479 aa  275  8e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  40.55 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  41.11 
 
 		 427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  42.37 
 
 		 416 aa  273  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  40.74 
 
 		 427 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  39.95 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  42.02 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  40.83 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  38 
 
 		 425 aa  269  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0719  sodium:dicarboxylate symporter  40.65 
 
 		 418 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3727  sodium:dicarboxylate symporter  40.4 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3853  sodium:dicarboxylate symporter  40.4 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000161512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  42.29 
 
 		 416 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3670  sodium:dicarboxylate symporter  40.15 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.200681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  37.94 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  37.94 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  38.17 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  38.61 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 417 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  38.17 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  37.79 
 
 		 444 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  37.74 
 
 		 424 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  39.62 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  37.65 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  40.64 
 
 		 413 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  37.02 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  39.39 
 
 		 417 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>