195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1650 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  98.24 
 
 		 607 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  98.24 
 
 		 607 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  98.24 
 
 		 607 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  96.44 
 
 		 614 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  95.56 
 
 		 614 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  95.56 
 
 		 614 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  95.11 
 
 		 617 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  94.69 
 
 		 614 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  87.78 
 
 		 611 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  82.3 
 
 		 608 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  78.41 
 
 		 622 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  58.48 
 
 		 633 aa  288  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  59.38 
 
 		 616 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  59.38 
 
 		 616 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  59.38 
 
 		 618 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  59.38 
 
 		 616 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  59.38 
 
 		 616 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  57.92 
 
 		 602 aa  286  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  60.18 
 
 		 615 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  59.55 
 
 		 627 aa  285  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  59.28 
 
 		 615 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  59.73 
 
 		 615 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  59.73 
 
 		 615 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  59.73 
 
 		 628 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  57.59 
 
 		 614 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  57.92 
 
 		 613 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  57.21 
 
 		 625 aa  280  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  56.89 
 
 		 617 aa  279  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  57.08 
 
 		 617 aa  278  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  58.8 
 
 		 613 aa  276  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  57.4 
 
 		 624 aa  275  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  56.39 
 
 		 618 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  53 
 
 		 609 aa  267  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  52.27 
 
 		 609 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  52.27 
 
 		 609 aa  266  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  52.27 
 
 		 609 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  52.27 
 
 		 609 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  52.27 
 
 		 609 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  52.27 
 
 		 611 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  52.27 
 
 		 609 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  52.27 
 
 		 609 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  53.57 
 
 		 630 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  56.62 
 
 		 605 aa  263  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  51.6 
 
 		 616 aa  262  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  54.02 
 
 		 625 aa  261  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  50.9 
 
 		 611 aa  260  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  52.23 
 
 		 628 aa  259  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  51.14 
 
 		 616 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  51.14 
 
 		 610 aa  258  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  52.09 
 
 		 609 aa  257  9e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  50 
 
 		 629 aa  255  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  50.7 
 
 		 607 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  51.16 
 
 		 609 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  49.78 
 
 		 628 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  52.25 
 
 		 1283 aa  247  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  50.69 
 
 		 639 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  48.65 
 
 		 585 aa  240  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  50.68 
 
 		 621 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  53.02 
 
 		 611 aa  238  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  47.35 
 
 		 609 aa  238  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  51.83 
 
 		 605 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  50.68 
 
 		 635 aa  235  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  50.23 
 
 		 635 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  50.23 
 
 		 635 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  50.48 
 
 		 636 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  49.09 
 
 		 621 aa  230  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  46.88 
 
 		 629 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  49.75 
 
 		 601 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  47.09 
 
 		 588 aa  219  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  47.25 
 
 		 619 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  48.73 
 
 		 601 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  48.73 
 
 		 601 aa  218  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  48.73 
 
 		 601 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  51.03 
 
 		 594 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  49.49 
 
 		 603 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  48.42 
 
 		 608 aa  216  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  48.73 
 
 		 603 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  48.73 
 
 		 603 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  48.73 
 
 		 603 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  47.93 
 
 		 604 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  47.21 
 
 		 602 aa  215  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  47.96 
 
 		 608 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  48.22 
 
 		 603 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  47.72 
 
 		 599 aa  214  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  44.29 
 
 		 610 aa  214  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  46.15 
 
 		 583 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  45.41 
 
 		 546 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  47.96 
 
 		 591 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  49.3 
 
 		 587 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  45.74 
 
 		 637 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  45.09 
 
 		 635 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  45.89 
 
 		 551 aa  211  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  45.5 
 
 		 621 aa  211  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  50.49 
 
 		 610 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  45.33 
 
 		 605 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  48.19 
 
 		 589 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  43.56 
 
 		 610 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  45.92 
 
 		 595 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  46.67 
 
 		 599 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>