229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0028 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  92.92 
 
 
480 aa  881  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04543e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  95.21 
 
 
480 aa  899  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  1.65872e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  92.92 
 
 
480 aa  881  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  100 
 
 
480 aa  966  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  92.92 
 
 
480 aa  881  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  81.04 
 
 
480 aa  745  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  82.5 
 
 
480 aa  797  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  92.92 
 
 
480 aa  881  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  80.42 
 
 
480 aa  770  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  74.38 
 
 
480 aa  731  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  81.88 
 
 
480 aa  793  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  95.62 
 
 
480 aa  904  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  95.21 
 
 
480 aa  901  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  77.71 
 
 
480 aa  776  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  92.29 
 
 
480 aa  883  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  57.8 
 
 
481 aa  561  1e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  57.29 
 
 
481 aa  555  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  57.08 
 
 
481 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  56.18 
 
 
481 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  54.13 
 
 
483 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  53.75 
 
 
483 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  52.51 
 
 
484 aa  459  1e-128  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  52.82 
 
 
484 aa  459  1e-128  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  53.03 
 
 
484 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  49.46 
 
 
484 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  51.98 
 
 
484 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  51.46 
 
 
484 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  50.11 
 
 
484 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  49.68 
 
 
484 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  49.17 
 
 
484 aa  441  1e-122  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  49.67 
 
 
484 aa  439  1e-122  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  51.24 
 
 
484 aa  441  1e-122  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  48.39 
 
 
484 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  48.96 
 
 
484 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  48.6 
 
 
484 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  48.31 
 
 
490 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  4.55151e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  46.15 
 
 
472 aa  399  1e-110  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  47.5 
 
 
481 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  42.21 
 
 
482 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  40.75 
 
 
482 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  48.03 
 
 
493 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  40.7 
 
 
482 aa  357  4e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  40 
 
 
485 aa  355  9e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  40.95 
 
 
466 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  41.8 
 
 
498 aa  339  6e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  41.52 
 
 
500 aa  336  4e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  43.36 
 
 
498 aa  336  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.56 
 
 
466 aa  336  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  41.65 
 
 
466 aa  329  6e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  35.83 
 
 
478 aa  319  8e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  39.12 
 
 
510 aa  312  7e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  37.03 
 
 
481 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  36.72 
 
 
482 aa  308  1e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  36.98 
 
 
482 aa  307  2e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.98 
 
 
482 aa  307  2e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  38.15 
 
 
484 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  36.85 
 
 
484 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  37.89 
 
 
484 aa  299  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.85 
 
 
484 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  36.86 
 
 
484 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.68 
 
 
485 aa  289  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.7 
 
 
494 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.11 
 
 
485 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.2 
 
 
481 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.28 
 
 
483 aa  286  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  34.16 
 
 
479 aa  285  1e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  34.97 
 
 
485 aa  285  1e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  37.28 
 
 
488 aa  283  5e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.7 
 
 
482 aa  282  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  36.86 
 
 
488 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  35.32 
 
 
466 aa  281  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  32.64 
 
 
479 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  36.32 
 
 
478 aa  279  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  36.42 
 
 
484 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  34.76 
 
 
483 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.79 
 
 
485 aa  277  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  35.21 
 
 
483 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  35.07 
 
 
491 aa  276  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.34 
 
 
483 aa  276  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  34.97 
 
 
498 aa  274  2e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  38.56 
 
 
484 aa  275  2e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  35.63 
 
 
498 aa  273  5e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  34.5 
 
 
483 aa  270  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.94 
 
 
485 aa  269  7e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  33.75 
 
 
482 aa  269  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  35.67 
 
 
483 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  35.68 
 
 
486 aa  268  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.4 
 
 
485 aa  267  3e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  34.38 
 
 
476 aa  267  3e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  34.56 
 
 
488 aa  267  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.46 
 
 
483 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  37.39 
 
 
485 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  35.66 
 
 
485 aa  266  6e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  36.23 
 
 
491 aa  266  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  35.56 
 
 
485 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  34.56 
 
 
488 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.08 
 
 
482 aa  262  9e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  32.73 
 
 
487 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  33.96 
 
 
481 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  36.97 
 
 
487 aa  260  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>