123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0329 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  100 
 
 		 402 aa  803    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  84.29 
 
 		 404 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  84.29 
 
 		 404 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  28.39 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  28.39 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  28.39 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  28.39 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  28.39 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  28.39 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  28.39 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  29.07 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  28.98 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  28.98 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  28.98 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  28.46 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  28.46 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  28.21 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  28.21 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  28.21 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  28.21 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  27.6 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  27.82 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  28.16 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  28.45 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  26 
 
 		 415 aa  125  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  27.62 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  27.9 
 
 		 392 aa  122  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  29.75 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  27.01 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  25.14 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  26.8 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  23.9 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 444 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  25.52 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  25.52 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  25.52 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  25.52 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  25.52 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  25.27 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  25.52 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  25.52 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  25.52 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  25.52 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  26.04 
 
 		 393 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  25.78 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  25.78 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  25.78 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  25.78 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  21.59 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  20.56 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  24.05 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  26.64 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.92 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  27.48 
 
 		 160 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.69 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.69 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  27.14 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.68 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.29 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  25.41 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  31.03 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 453 aa  46.6  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  25.97 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  22.25 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>