More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0324 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  254  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  76.52 
 
 		 121 aa  186  9e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  44.7 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  50.91 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  42.34 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1710  RNA-binding protein  40.8 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.034913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1228  RNA-binding protein  36.59 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0834946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  44.23 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  45.19 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  45.19 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0448  RNA-binding protein  40.35 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.308089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  44.23 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  44.23 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  43.93 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  41.23 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  41.23 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  41.23 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  41.23 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  41.23 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  44.05 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  38.18 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  38.18 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.11 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.3 
 
 		 755 aa  77.4  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  46.74 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3588  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.3 
 
 		 746 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0949  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.3 
 
 		 747 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  46.99 
 
 		 321 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.95 
 
 		 514 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  50.65 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  45.78 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0788  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  38.78 
 
 		 732 aa  73.6  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000677019  normal  0.144869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.78 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  49.35 
 
 		 161 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  49.35 
 
 		 161 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.59 
 
 		 503 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.04 
 
 		 777 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  49.35 
 
 		 161 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  49.35 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  49.35 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  49.35 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  49.35 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  49.35 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  49.35 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  49.35 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  35.54 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  38.18 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  46.67 
 
 		 485 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  44.71 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  43.37 
 
 		 390 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  42.17 
 
 		 367 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  35.92 
 
 		 578 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  35.96 
 
 		 686 aa  68.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  45.33 
 
 		 491 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  43.37 
 
 		 328 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  45.33 
 
 		 491 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  45.33 
 
 		 488 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  45.33 
 
 		 496 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  45.33 
 
 		 492 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  36.94 
 
 		 733 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  45.33 
 
 		 490 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  42.17 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  34.95 
 
 		 568 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.63 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.21 
 
 		 736 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  34.95 
 
 		 568 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  34.95 
 
 		 568 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  42.17 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10960  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  44.93 
 
 		 743 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000522629  unclonable  0.00000000397306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  42.11 
 
 		 500 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  42.11 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1628  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  43.48 
 
 		 741 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  38.46 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  43.66 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  42.11 
 
 		 487 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  45.33 
 
 		 488 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1150  30S ribosomal protein S1  40.74 
 
 		 400 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000136012  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 		 427 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0380  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  38.81 
 
 		 703 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000345435  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  36.71 
 
 		 562 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  38.96 
 
 		 587 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  44.05 
 
 		 479 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  44.05 
 
 		 479 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  44.05 
 
 		 479 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  43.84 
 
 		 557 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  45.95 
 
 		 500 aa  64.7  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  45.57 
 
 		 418 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  42.67 
 
 		 493 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.75 
 
 		 411 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  36.89 
 
 		 396 aa  64.3  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  44 
 
 		 493 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.89 
 
 		 403 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  32.06 
 
 		 619 aa  64.3  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  40 
 
 		 694 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5112  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  50.82 
 
 		 825 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191033  normal  0.121153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0729  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.24 
 
 		 695 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  40.24 
 
 		 408 aa  63.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  43.42 
 
 		 499 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>