More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0083 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 338 aa  683    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  58.87 
 
 		 353 aa  360  1e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  61.37 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  67.34 
 
 		 293 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  58.99 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  57.66 
 
 		 351 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  54.43 
 
 		 312 aa  328  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  53.53 
 
 		 375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  44.51 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  50 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  49.26 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  48.89 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  43.5 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  47.96 
 
 		 341 aa  287  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  43.29 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  48.55 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  38.22 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  39.09 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  33.96 
 
 		 911 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  32.7 
 
 		 455 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  31.99 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  32.65 
 
 		 878 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  29.41 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 		 856 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  29.17 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  30.33 
 
 		 857 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  31.62 
 
 		 912 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  31.42 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  29.81 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  34.34 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  30.38 
 
 		 526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.08 
 
 		 527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  31.14 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  31.04 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  29.18 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  34.13 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  31.67 
 
 		 952 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  33.73 
 
 		 431 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  34.35 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  30.84 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  32.41 
 
 		 876 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  29.34 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  29.59 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  29.94 
 
 		 433 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  29.94 
 
 		 433 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  30.84 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  30.84 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  32.95 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  30.84 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  33.33 
 
 		 446 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  33.73 
 
 		 432 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  33.73 
 
 		 432 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  32.56 
 
 		 474 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  30.24 
 
 		 431 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  30.84 
 
 		 431 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  29.51 
 
 		 481 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  32.94 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  30 
 
 		 510 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  29.96 
 
 		 526 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  29.75 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  29.04 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  29.92 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  29.89 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  29.89 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 		 459 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  32.16 
 
 		 467 aa  106  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  32.82 
 
 		 470 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  33.21 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  31.37 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  30.5 
 
 		 479 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.76 
 
 		 544 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  32.84 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  29.24 
 
 		 451 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  31.08 
 
 		 534 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  31.6 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  26.58 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  31.23 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  31.66 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.47 
 
 		 549 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  31.92 
 
 		 449 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  29.04 
 
 		 535 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  37.59 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  38 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  33.46 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  33.46 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  37.59 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  39.86 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  29.85 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  29.85 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.52 
 
 		 487 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  28.61 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  32.57 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  36.84 
 
 		 546 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  30.63 
 
 		 551 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  30.63 
 
 		 551 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  41.45 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  37.59 
 
 		 546 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  29.34 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  32.1 
 
 		 460 aa  99.4  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>