More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2425 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  100 
 
 		 457 aa  916    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  37.33 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  37.56 
 
 		 452 aa  272  8.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  37.59 
 
 		 475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  37.84 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  36.57 
 
 		 475 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  36.58 
 
 		 475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  37.79 
 
 		 473 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  36.58 
 
 		 475 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  34.98 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  35.39 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  37.36 
 
 		 467 aa  240  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  34.87 
 
 		 473 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  37.41 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  36.3 
 
 		 489 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  34.73 
 
 		 477 aa  237  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  36.3 
 
 		 471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  37.27 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  36.49 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  34.43 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  30.75 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  36.71 
 
 		 460 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  31.58 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  29.81 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  31.6 
 
 		 461 aa  156  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  28.72 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  27.56 
 
 		 486 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  26.47 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  24.94 
 
 		 473 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  28.05 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  37.17 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  27.53 
 
 		 486 aa  113  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  27.35 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  26.78 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  25.87 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  25.87 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  25.87 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  25.87 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  27.36 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  25.58 
 
 		 489 aa  111  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  28.69 
 
 		 562 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  27.09 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.17 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  25.45 
 
 		 489 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  25.84 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  25.84 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  25.84 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  25.32 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  25.84 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  25.32 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  25.78 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  25.12 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  25.92 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  36.18 
 
 		 605 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  26.89 
 
 		 488 aa  106  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  35.64 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  34.98 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  26.8 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  33.51 
 
 		 564 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  33.51 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  33.51 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  26.01 
 
 		 484 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  33.51 
 
 		 588 aa  103  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  33.19 
 
 		 590 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  38.89 
 
 		 553 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  24.84 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  25.33 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  33 
 
 		 564 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  32.74 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  32.51 
 
 		 564 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  27.53 
 
 		 553 aa  101  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  33.5 
 
 		 589 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  26.27 
 
 		 487 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  27.44 
 
 		 487 aa  100  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  32.74 
 
 		 589 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  32.74 
 
 		 572 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  32.74 
 
 		 572 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  32.74 
 
 		 560 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  27.09 
 
 		 561 aa  99  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  32.74 
 
 		 589 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  32.74 
 
 		 572 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  32.74 
 
 		 572 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  27.44 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  26.65 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  27.18 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  27.18 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  27.18 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  27.18 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  28.57 
 
 		 518 aa  97.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  27.18 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  27.18 
 
 		 487 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  27.35 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  26.5 
 
 		 488 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.22 
 
 		 424 aa  97.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  29.27 
 
 		 479 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  26.91 
 
 		 487 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  24.88 
 
 		 503 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  26.28 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>