More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3030 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  97.48 
 
 		 436 aa  826    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  87.3 
 
 		 436 aa  759    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  100 
 
 		 436 aa  881    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  76.79 
 
 		 438 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  66.91 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  64.69 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  46.02 
 
 		 418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  45.73 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  42.33 
 
 		 412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  41.33 
 
 		 410 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  43.4 
 
 		 409 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  45.06 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  40.94 
 
 		 432 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  45.13 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  40.69 
 
 		 415 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  41.69 
 
 		 416 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  39.15 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  38.64 
 
 		 413 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  38.64 
 
 		 413 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  36.73 
 
 		 409 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  32.46 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  31.33 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  31.19 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  31.22 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  29.05 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  29.18 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  29.97 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  29.32 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  32.13 
 
 		 391 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  32.46 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  32.46 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  29.69 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.79 
 
 		 394 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  29.4 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  27.96 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  27.71 
 
 		 407 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  31.19 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  31.98 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.05 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  29.53 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  29.53 
 
 		 382 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  29.17 
 
 		 409 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  30 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  29.02 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  28.22 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  25.85 
 
 		 374 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.53 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  28.35 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  28.54 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  27.12 
 
 		 383 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  28.23 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  30.03 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.61 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.61 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  29.22 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  28.61 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  26.77 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.85 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  31.1 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  27.04 
 
 		 423 aa  107  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  26.33 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  26.9 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  24.67 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  24.08 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  25.79 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  26.33 
 
 		 376 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  28.19 
 
 		 401 aa  99.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  30.35 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  26.96 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  25.46 
 
 		 376 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  28.04 
 
 		 387 aa  97.1  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  27.75 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  24.94 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  27.47 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  25 
 
 		 376 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  24.08 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  22.97 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  26.64 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  24.93 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  24.81 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  25.37 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  25.3 
 
 		 370 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  24.75 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  25.49 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  25.74 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  26.69 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  24.44 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  23.43 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.64 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  24.82 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  29.79 
 
 		 361 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  24.51 
 
 		 383 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.51 
 
 		 383 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  24.51 
 
 		 383 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  24.24 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  24.24 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  24.08 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  24.24 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>