183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2377 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 486 aa  955    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  60.49 
 
 		 489 aa  551  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 488 aa  249  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  31.72 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  31.72 
 
 		 490 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 479 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 		 487 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  32.71 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 487 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 		 502 aa  161  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  29.24 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  28.16 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.75 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  21.75 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.54 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 507 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 		 500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 475 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 476 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 483 aa  136  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 		 509 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 		 509 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  30.48 
 
 		 497 aa  134  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  26.72 
 
 		 488 aa  132  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  30.02 
 
 		 510 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  33.22 
 
 		 508 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  30.02 
 
 		 510 aa  131  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  31.42 
 
 		 501 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  31.38 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  27.3 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  30.35 
 
 		 504 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  30.35 
 
 		 504 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 502 aa  126  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  28.07 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  29.07 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 493 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.06 
 
 		 508 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.69 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 499 aa  120  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.44 
 
 		 492 aa  120  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.44 
 
 		 492 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.44 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.44 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.19 
 
 		 492 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.19 
 
 		 492 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 480 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.88 
 
 		 503 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.88 
 
 		 510 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.88 
 
 		 510 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 		 501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.88 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.88 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  23.16 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 		 514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.55 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 498 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  30.12 
 
 		 504 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  31.07 
 
 		 575 aa  106  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 498 aa  106  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  26.88 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 494 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 508 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 533 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 		 507 aa  97.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 		 472 aa  96.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  24.27 
 
 		 492 aa  96.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 507 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 488 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 500 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 467 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  21.95 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.66 
 
 		 502 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>