117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0808 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  87.5 
 
 		 331 aa  574  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  48.87 
 
 		 310 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  49.68 
 
 		 312 aa  292  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  48.42 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  47.71 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  47.57 
 
 		 311 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  46.3 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  47.25 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  43.48 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  41.64 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  45.57 
 
 		 310 aa  228  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  36.25 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.46 
 
 		 680 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  37.84 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  39.08 
 
 		 239 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  45.09 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  38.89 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  37.79 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  36.86 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  38.05 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  45.07 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  41.94 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  41.55 
 
 		 319 aa  185  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  39.93 
 
 		 320 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  35.84 
 
 		 326 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  33.23 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  37.38 
 
 		 329 aa  175  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  36.69 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  40.19 
 
 		 237 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  52.83 
 
 		 244 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  35.5 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  31.69 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  38.14 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  31.79 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  34.93 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  37.68 
 
 		 266 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  29.39 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  35.89 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  32.7 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 231 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  33.09 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  24.8 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  30.73 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.32 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  22.08 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0630  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.31 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1109  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.31 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.038115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1068  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.31 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0439082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.71 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2194  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.71 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734508  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0989  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.71 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197702  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  29.2 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  21.34 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  24.85 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4222  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.11 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2919  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.11 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00151708  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1706  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0251054  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.22 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0817  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.65 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00537332  normal  0.704127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.11 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.4 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2836  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1434  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.347624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 197 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0519  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2492  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0107198  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00347388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2803  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000449435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2864  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1815  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.4 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.79 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  21.6 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.81 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3837  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.49 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.1 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  27.22 
 
 		 514 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 514 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 514 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.12 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>