202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2605 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  100 
 
 		 795 aa  1622    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  50.72 
 
 		 778 aa  755    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  52.72 
 
 		 794 aa  854    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  51.67 
 
 		 799 aa  828    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  38.6 
 
 		 765 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  39.2 
 
 		 760 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  40.87 
 
 		 779 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  37.97 
 
 		 757 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  37.48 
 
 		 765 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  40.35 
 
 		 770 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  39.59 
 
 		 780 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  40.08 
 
 		 772 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  39.85 
 
 		 774 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  38.46 
 
 		 772 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  36.68 
 
 		 771 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  38.27 
 
 		 772 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  38.09 
 
 		 772 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  38.27 
 
 		 772 aa  379  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  38.09 
 
 		 772 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  36.41 
 
 		 764 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  38.27 
 
 		 772 aa  379  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  36.88 
 
 		 764 aa  379  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  38.2 
 
 		 772 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  38.09 
 
 		 772 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  37.19 
 
 		 772 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  36.73 
 
 		 775 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  37.37 
 
 		 772 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  37.37 
 
 		 772 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  37.33 
 
 		 775 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  37.19 
 
 		 772 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  37.19 
 
 		 772 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  36.31 
 
 		 804 aa  369  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  38.16 
 
 		 775 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  35.42 
 
 		 772 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  37.77 
 
 		 749 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  38.39 
 
 		 681 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  38.38 
 
 		 760 aa  363  6e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  39.2 
 
 		 777 aa  363  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  38.22 
 
 		 763 aa  362  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  35.29 
 
 		 823 aa  359  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  39.31 
 
 		 712 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  39.58 
 
 		 766 aa  351  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  37.24 
 
 		 780 aa  348  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  38.94 
 
 		 763 aa  343  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  36.84 
 
 		 760 aa  341  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 		 695 aa  330  7e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  33.28 
 
 		 770 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  28.64 
 
 		 752 aa  302  1e-80  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  30.26 
 
 		 784 aa  303  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  31.49 
 
 		 828 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  31.5 
 
 		 836 aa  274  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  30 
 
 		 801 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  32.06 
 
 		 779 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  29.41 
 
 		 779 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  24.77 
 
 		 755 aa  261  3e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.7 
 
 		 792 aa  250  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  30.9 
 
 		 803 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  29.61 
 
 		 768 aa  238  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.01 
 
 		 799 aa  236  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  30.21 
 
 		 779 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  30.9 
 
 		 668 aa  233  8.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  26.07 
 
 		 776 aa  233  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  30.62 
 
 		 608 aa  232  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.44 
 
 		 752 aa  224  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  26.62 
 
 		 797 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  25.85 
 
 		 821 aa  223  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.67 
 
 		 794 aa  223  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  30.12 
 
 		 806 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  29.01 
 
 		 783 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  26.83 
 
 		 746 aa  219  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  26.42 
 
 		 845 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  27.4 
 
 		 777 aa  218  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  26.7 
 
 		 839 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.38 
 
 		 785 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  29.12 
 
 		 784 aa  211  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.6 
 
 		 788 aa  211  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4630  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 		 744 aa  210  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  31.38 
 
 		 695 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  28.27 
 
 		 690 aa  207  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  30.16 
 
 		 1024 aa  207  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  30.26 
 
 		 679 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  29.66 
 
 		 821 aa  206  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  30.08 
 
 		 679 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  30.08 
 
 		 679 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 699 aa  204  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  29.94 
 
 		 803 aa  204  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  25.88 
 
 		 791 aa  204  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  30.84 
 
 		 679 aa  203  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  29.7 
 
 		 679 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  29.7 
 
 		 679 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  26.79 
 
 		 728 aa  202  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 		 806 aa  202  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  28.47 
 
 		 791 aa  201  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  27.63 
 
 		 836 aa  200  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 		 795 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  27.91 
 
 		 806 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  29.15 
 
 		 803 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  26.53 
 
 		 795 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  28.15 
 
 		 806 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  26.51 
 
 		 825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>