200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4630 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4630  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 744 aa  1499    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  29.68 
 
 		 795 aa  211  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  30.76 
 
 		 765 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 		 778 aa  195  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  27.81 
 
 		 712 aa  195  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.7 
 
 		 765 aa  194  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  28.12 
 
 		 681 aa  193  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  29.43 
 
 		 771 aa  183  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  27.4 
 
 		 794 aa  183  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  27.35 
 
 		 760 aa  183  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  29.24 
 
 		 775 aa  181  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  29.06 
 
 		 749 aa  178  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  28.17 
 
 		 760 aa  177  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  28.37 
 
 		 779 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  26.39 
 
 		 801 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  27.78 
 
 		 764 aa  171  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 799 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  27.78 
 
 		 764 aa  171  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  27.88 
 
 		 774 aa  170  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  29.25 
 
 		 766 aa  170  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.15 
 
 		 828 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  28.92 
 
 		 779 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  30.23 
 
 		 763 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  27.69 
 
 		 804 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  26.55 
 
 		 752 aa  164  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  28.07 
 
 		 775 aa  164  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  26.85 
 
 		 757 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  25.27 
 
 		 770 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  26.24 
 
 		 760 aa  159  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 784 aa  159  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  27.53 
 
 		 777 aa  158  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  26.68 
 
 		 772 aa  157  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  28.1 
 
 		 779 aa  156  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  24.35 
 
 		 792 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  25.21 
 
 		 779 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  25.57 
 
 		 770 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  24.79 
 
 		 799 aa  153  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  25.97 
 
 		 687 aa  153  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  28.94 
 
 		 695 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  25.71 
 
 		 780 aa  151  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  26.53 
 
 		 768 aa  150  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  21.4 
 
 		 752 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  25.94 
 
 		 772 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  24.65 
 
 		 772 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  25.76 
 
 		 772 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  25.12 
 
 		 743 aa  147  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  30.12 
 
 		 845 aa  147  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  25.76 
 
 		 772 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  24.86 
 
 		 777 aa  146  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  26.05 
 
 		 772 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  26.05 
 
 		 772 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  25.76 
 
 		 772 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  26.36 
 
 		 772 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  26.05 
 
 		 772 aa  145  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  26.05 
 
 		 772 aa  145  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  26.05 
 
 		 772 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  25.87 
 
 		 772 aa  145  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  27.19 
 
 		 803 aa  144  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  27.14 
 
 		 679 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  27.14 
 
 		 679 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  25.65 
 
 		 823 aa  143  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  27.14 
 
 		 679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  25.04 
 
 		 821 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  25.04 
 
 		 797 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  26.2 
 
 		 668 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  26.93 
 
 		 679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  25.58 
 
 		 772 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  23.68 
 
 		 836 aa  142  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  25 
 
 		 775 aa  142  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  26.72 
 
 		 679 aa  141  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  27.72 
 
 		 803 aa  141  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 		 699 aa  140  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  25.68 
 
 		 763 aa  140  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  26.25 
 
 		 780 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.28 
 
 		 788 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4229  alpha-glucosidase  25.75 
 
 		 678 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  30.03 
 
 		 815 aa  137  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  26.27 
 
 		 825 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.42 
 
 		 839 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  25.04 
 
 		 772 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  24.1 
 
 		 794 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4407  alpha-glucosidase  25.59 
 
 		 678 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264935  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  25.7 
 
 		 667 aa  135  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4341  alpha-glucosidase  25.5 
 
 		 678 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  24.3 
 
 		 683 aa  135  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4295  alpha-glucosidase  25.5 
 
 		 678 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  27.31 
 
 		 806 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  25.7 
 
 		 654 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  25.7 
 
 		 678 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  25.7 
 
 		 678 aa  134  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  26.35 
 
 		 679 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.92 
 
 		 788 aa  134  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4250  alpha-glucosidase  25.29 
 
 		 678 aa  134  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  25.37 
 
 		 678 aa  134  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  25.34 
 
 		 821 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.66 
 
 		 791 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  25.94 
 
 		 661 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  26.26 
 
 		 783 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  25.45 
 
 		 806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  25.98 
 
 		 785 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>