117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5902 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  100 
 
 		 152 aa  310  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5770  response regulator receiver protein  55.66 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.04 
 
 		 384 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  40.82 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.04 
 
 		 384 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  38.38 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  43.24 
 
 		 846 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.79 
 
 		 844 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.89 
 
 		 847 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  37.37 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  41.1 
 
 		 847 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  41.1 
 
 		 847 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6170  hypothetical protein  38.46 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  31.13 
 
 		 376 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2345  response regulator receiver domain-containing protein  37.25 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1555  hypothetical protein  35.14 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  30.61 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 		 844 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  40.24 
 
 		 875 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  35.06 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  31.51 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  31.58 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  39.73 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  35.62 
 
 		 852 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  34.09 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  35.62 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  32.47 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  35.06 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  32.47 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  36.49 
 
 		 855 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5777  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0732019  hitchhiker  0.00995229 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  31.13 
 
 		 107 aa  47.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  34.67 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.9 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  29.91 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  36.11 
 
 		 856 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1275  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 472 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0891685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  32.47 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 602 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.56 
 
 		 704 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  32.47 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  34.94 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  36.14 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.21 
 
 		 849 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.05 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  38.67 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  28.48 
 
 		 238 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2091  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 132 aa  43.9  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.494931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  29.45 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12408  two-component system response regulator  34.33 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.401855  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  38.16 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  29.49 
 
 		 856 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  30.49 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  38.16 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0271  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.62 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  30.88 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1262  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2922  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.67 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  27.97 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.62 
 
 		 457 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 631 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0432  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 1111 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1788  response regulator receiver domain-containing protein  30.26 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 123 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  30.33 
 
 		 230 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  34.21 
 
 		 842 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4556  response regulator  33.33 
 
 		 155 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2179  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.896157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 132 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 636 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  31.17 
 
 		 160 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  31.82 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  29.21 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  29.87 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2661  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 559 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>