More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0878 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
317 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  85.48 
 
 
310 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  45.97 
 
 
307 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
296 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
286 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  31.15 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  25.45 
 
 
304 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  31.15 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
504 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
363 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
290 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  29.86 
 
 
300 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
295 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
292 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  24.73 
 
 
304 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.16 
 
 
295 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 
284 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
340 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0140  hypothetical protein  26.88 
 
 
281 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  25.18 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.91 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
312 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.61 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  27.4 
 
 
453 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  26.09 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18171  alpha/beta fold family hydrolase  24 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  26.42 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  24.03 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  26.42 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  28.21 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20811  alpha/beta fold family hydrolase  22.83 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.509173  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1206  putative alpha/beta hydrolase superfamily  24.24 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  27.06 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17551  alpha/beta fold family hydrolase  22.9 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.07 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  23.88 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  23.88 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.23 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01651  putative alpha/beta hydrolase superfamily  27.5 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  23.88 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.1 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  21.63 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  24.09 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.4 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.82 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.4 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.65 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  26.02 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.11 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  23.13 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.7 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  25.81 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.9 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>