More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2640 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  91.89 
 
 		 296 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  91.22 
 
 		 296 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  80.07 
 
 		 296 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  85.81 
 
 		 319 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  81.76 
 
 		 296 aa  484  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  75.34 
 
 		 296 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  71.72 
 
 		 300 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  71.13 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  66.22 
 
 		 299 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  71.03 
 
 		 296 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  70.69 
 
 		 296 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  70.69 
 
 		 296 aa  417  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  65.76 
 
 		 298 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  69.07 
 
 		 299 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  67.23 
 
 		 297 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  64.14 
 
 		 291 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  65.41 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  64.51 
 
 		 294 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  62.98 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  65.19 
 
 		 294 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  62.67 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  62.71 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  65.17 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  60.48 
 
 		 294 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  63.67 
 
 		 290 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  60.62 
 
 		 293 aa  364  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  61.86 
 
 		 293 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  64.16 
 
 		 294 aa  363  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  60.27 
 
 		 293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  61.94 
 
 		 291 aa  361  7.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  59.66 
 
 		 291 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  57.79 
 
 		 297 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  64.01 
 
 		 299 aa  344  8.999999999999999e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  61.03 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  55.52 
 
 		 293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  56.16 
 
 		 293 aa  324  9e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  55.63 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  52.3 
 
 		 290 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 292 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 292 aa  295  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  50.51 
 
 		 291 aa  285  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  49.82 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 301 aa  275  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 298 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  47.44 
 
 		 294 aa  275  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  46.26 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.71 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  47.64 
 
 		 296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  46.37 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 		 290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 295 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  48.28 
 
 		 320 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  51.67 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 292 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  44.97 
 
 		 307 aa  262  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  45.7 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>