More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2762 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  75.06 
 
 		 445 aa  674    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  76.13 
 
 		 444 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  100 
 
 		 464 aa  929    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  81.98 
 
 		 444 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  53.88 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  52.02 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  48.8 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  47.87 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  47.42 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  46.52 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  46.74 
 
 		 447 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  46.23 
 
 		 446 aa  338  9e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  44.76 
 
 		 445 aa  309  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  45.41 
 
 		 445 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  40.33 
 
 		 434 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  39.46 
 
 		 438 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  39.46 
 
 		 438 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  39.62 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  37.1 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.38 
 
 		 442 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  40.09 
 
 		 438 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  35.15 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  35.02 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  37.5 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  38.62 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  39.75 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  33.02 
 
 		 419 aa  167  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  30.86 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.67 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.83 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  25.94 
 
 		 419 aa  96.7  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.05 
 
 		 430 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  34.48 
 
 		 425 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.91 
 
 		 448 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  33.16 
 
 		 450 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  31.4 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.84 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  32.02 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.3 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.38 
 
 		 678 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.94 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  31.48 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.72 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  24.01 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.87 
 
 		 232 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  31.91 
 
 		 678 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  28.85 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  30.48 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.04 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.11 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.29 
 
 		 675 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  25.49 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.75 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.88 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  25.99 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.08 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.24 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  27.55 
 
 		 605 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.79 
 
 		 669 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.65 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  28.89 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  29.63 
 
 		 691 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  29.67 
 
 		 662 aa  67  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.02 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.54 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.08 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.12 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.57 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  26.94 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  25.25 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.42 
 
 		 681 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.94 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.16 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  27.59 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  21.75 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.58 
 
 		 676 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  24.15 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  33.56 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  27.42 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.85 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  27.11 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  23.23 
 
 		 232 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  26.32 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.79 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  27.81 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  25.74 
 
 		 321 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  26.11 
 
 		 321 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4810  ferredoxin  31.37 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  25.74 
 
 		 321 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.14 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.65 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  30.43 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.67 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  27.56 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.65 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.15 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  27.23 
 
 		 606 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  27.23 
 
 		 606 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  27.7 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  29.53 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>