More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3051 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  100 
 
 
441 aa  908    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  36.79 
 
 
444 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  36.47 
 
 
445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  35.65 
 
 
446 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.9 
 
 
443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  35.02 
 
 
464 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  37.53 
 
 
438 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  37.53 
 
 
438 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  36.23 
 
 
445 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  35.01 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  36.08 
 
 
444 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  35.55 
 
 
434 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  35.55 
 
 
434 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  35.1 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  35.94 
 
 
447 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  35.82 
 
 
447 aa  229  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  33.98 
 
 
447 aa  229  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  34.22 
 
 
447 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  34.3 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  33.8 
 
 
446 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  32.24 
 
 
440 aa  209  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  35.07 
 
 
443 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  33.18 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  34.22 
 
 
445 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  32.95 
 
 
443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  33.86 
 
 
489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.53 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.56 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  24.68 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  22.56 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.4 
 
 
430 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  22.76 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.87 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.05 
 
 
421 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.18 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  30 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0492  ferric reductase  23.08 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.673317  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.67 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  25.11 
 
 
336 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  30 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.97 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  26.69 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.38 
 
 
339 aa  77  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  20.55 
 
 
445 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.17 
 
 
929 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.88 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  27.86 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.78 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.69 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.44 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.73 
 
 
752 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.32 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.07 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.38 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.88 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  25.45 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.67 
 
 
494 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.81 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.19 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.71 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.5 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.53 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0440223  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2721  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit  24.75 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32110  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer component  25.13 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.64 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  25 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  31.03 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  31.03 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.11 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  24.89 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.76 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2323  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  26.16 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  21.02 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.11 
 
 
341 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.6 
 
 
340 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.6 
 
 
340 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 
1148 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3163  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.02 
 
 
336 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141012  normal  0.450185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1593  putative ferredoxin NAD(+) reductase  24.45 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  25.75 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0951  propane monoxygenase reductase  23.87 
 
 
353 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.95 
 
 
336 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2708  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.02 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  22.67 
 
 
481 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  24.64 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  24.03 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  28.96 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  23.59 
 
 
496 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  30.56 
 
 
319 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.01 
 
 
340 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  25.4 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1179  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.13 
 
 
342 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  21.59 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4410  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.77 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.17 
 
 
456 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  20.57 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  21.59 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  27.98 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5674  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  25.93 
 
 
332 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>