More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3017 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  71.14 
 
 
447 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  71.59 
 
 
447 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  100 
 
 
447 aa  902    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  98.43 
 
 
447 aa  890    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  64.85 
 
 
446 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  55.21 
 
 
446 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  54.36 
 
 
443 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  54.29 
 
 
446 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  51.23 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  54.36 
 
 
445 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  46.74 
 
 
464 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  47.02 
 
 
444 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  45.58 
 
 
445 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  46.06 
 
 
444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  41.76 
 
 
442 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  44.15 
 
 
445 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  40.55 
 
 
438 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  39.6 
 
 
438 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  39.6 
 
 
438 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  39.49 
 
 
434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  35.41 
 
 
443 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  34.62 
 
 
440 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  39.58 
 
 
434 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  33.98 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  36.28 
 
 
460 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  35.96 
 
 
489 aa  209  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  29.59 
 
 
424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  30.28 
 
 
419 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.51 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.07 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.82 
 
 
430 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  22.91 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.43 
 
 
448 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  27.61 
 
 
481 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  32.5 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  28.51 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.62 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.26 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  31.58 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.96 
 
 
453 aa  69.7  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  31.43 
 
 
678 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.75 
 
 
678 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27 
 
 
232 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  26.35 
 
 
481 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.8 
 
 
676 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.16 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2019  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.44 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  26.59 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  26.64 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  24.88 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.05 
 
 
682 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.48 
 
 
678 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.72 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.31 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.8 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.01 
 
 
374 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.59 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  28.16 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.71 
 
 
669 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.49 
 
 
469 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.89 
 
 
421 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  30.33 
 
 
625 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  29.38 
 
 
356 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  26.54 
 
 
674 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  28.95 
 
 
691 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  29.86 
 
 
357 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  28.23 
 
 
395 aa  63.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  26.32 
 
 
365 aa  63.9  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.17 
 
 
261 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.03 
 
 
447 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.16 
 
 
406 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.35 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  31.32 
 
 
395 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.11 
 
 
456 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.84 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.12 
 
 
340 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.44 
 
 
342 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.27 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  24.22 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.76 
 
 
251 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.64 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.66 
 
 
254 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.88 
 
 
367 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1179  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.12 
 
 
342 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173064  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.57 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.96 
 
 
367 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.32 
 
 
390 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  27.7 
 
 
393 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  26.44 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  26.44 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  24.32 
 
 
307 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.16 
 
 
681 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.37 
 
 
690 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  23.55 
 
 
340 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  24.41 
 
 
496 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  26.67 
 
 
394 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.1 
 
 
687 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1299  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.85 
 
 
928 aa  60.1  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  30 
 
 
606 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.94 
 
 
339 aa  60.1  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>