More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4116 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  887    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  58.17 
 
 		 447 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  54.36 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  57.49 
 
 		 447 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  53.91 
 
 		 447 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  52.9 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  56.76 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  50.58 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  48.31 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  48.43 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  45.82 
 
 		 445 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  45.41 
 
 		 464 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  45.06 
 
 		 444 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  45.18 
 
 		 444 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  37.89 
 
 		 443 aa  289  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  34.46 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.91 
 
 		 445 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  38.4 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.54 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  36.67 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  36.67 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  34.22 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  36.94 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  37.56 
 
 		 434 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  38.72 
 
 		 489 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  36.03 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.22 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.68 
 
 		 419 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.15 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.79 
 
 		 430 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  24.87 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  33.33 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  25.78 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  31.35 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.55 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.94 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.32 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.65 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.96 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  26.18 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  30.23 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  30.39 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  28.51 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  28.51 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  30.14 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.73 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.52 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  24.84 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  23.92 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.34 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  26.47 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  28.43 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  29.5 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  29.5 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  27.8 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.78 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.48 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.29 
 
 		 682 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  28.22 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.56 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  29.77 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.19 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.8 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.98 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.78 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.93 
 
 		 469 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.36 
 
 		 1138 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  27.98 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.23 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.24 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  23.44 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.6 
 
 		 669 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  24.74 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  28.64 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.88 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.55 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  25.3 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.05 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  28.22 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.68 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  26.61 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.79 
 
 		 676 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  28.82 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  28.17 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  24.51 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  26.92 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  26.29 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.96 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  26.92 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  27.18 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.59 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1541  6,7-dihydropteridine reductase  28.05 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.32 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.12 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  27.96 
 
 		 625 aa  57.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  24.88 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  27.38 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.44 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>