More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4297 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 
421 aa  816    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  81.47 
 
 
421 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  74.82 
 
 
420 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  68.94 
 
 
425 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.07 
 
 
419 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.65 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  25.4 
 
 
419 aa  119  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  27.03 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.4 
 
 
419 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  28.41 
 
 
442 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  28.16 
 
 
424 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  29.64 
 
 
434 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  31.46 
 
 
450 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  30.27 
 
 
446 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  29.4 
 
 
434 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  27.94 
 
 
445 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  28.57 
 
 
445 aa  100  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  26.54 
 
 
440 aa  99.8  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  30.66 
 
 
445 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.88 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  27.82 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  26.57 
 
 
444 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.26 
 
 
448 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  27.93 
 
 
438 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  27.93 
 
 
438 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  27.73 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.92 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.43 
 
 
447 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.49 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.48 
 
 
447 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  25.97 
 
 
443 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  27.02 
 
 
443 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  27.18 
 
 
481 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.88 
 
 
464 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.17 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  34.15 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.02 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  26.32 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.81 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  28.15 
 
 
460 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  26.3 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.49 
 
 
494 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  28.01 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.16 
 
 
453 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  25.66 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  21.45 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  28.46 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  26.36 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  25.06 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0492  ferric reductase  21.43 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.673317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.05 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.04 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.27 
 
 
340 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.03 
 
 
676 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.83 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2361  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.05 
 
 
514 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000108659 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.26 
 
 
752 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.53 
 
 
337 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  25.62 
 
 
393 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3391  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.89 
 
 
242 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00300696  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.07 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  28.34 
 
 
393 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  28.1 
 
 
339 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  35.59 
 
 
321 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  28.1 
 
 
339 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.43 
 
 
328 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.29 
 
 
328 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  21.76 
 
 
350 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.82 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2380  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  25.16 
 
 
409 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.650264  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  25.62 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  31.08 
 
 
326 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  26.98 
 
 
307 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  34.75 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.53 
 
 
340 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.53 
 
 
340 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1358  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.69 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0185  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  27.69 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2727  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.69 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1554  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.69 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.62 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0213  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.69 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.25 
 
 
335 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0440223  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.46 
 
 
340 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.34 
 
 
261 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1139  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30 
 
 
334 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.89 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  24.79 
 
 
396 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  28.1 
 
 
338 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0860  iron-sulfur cluster-binding protein/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  27.82 
 
 
327 aa  56.6  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.451181  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.23 
 
 
232 aa  56.6  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  34.75 
 
 
316 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.2 
 
 
341 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25 
 
 
342 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.09 
 
 
341 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  25.27 
 
 
340 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0984  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.82 
 
 
330 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.97 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.38 
 
 
691 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  25.27 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>