206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0093 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  100 
 
 
419 aa  838    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  49.16 
 
 
419 aa  425  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  33.25 
 
 
445 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  32.24 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  33.02 
 
 
464 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.38 
 
 
419 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  33.49 
 
 
444 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.86 
 
 
443 aa  159  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  30.37 
 
 
438 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  30.37 
 
 
438 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  30.57 
 
 
442 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
447 aa  143  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  29.3 
 
 
434 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  31.22 
 
 
443 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  28.99 
 
 
434 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  30.83 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.37 
 
 
446 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  24.49 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.51 
 
 
446 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  30.51 
 
 
447 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  30.51 
 
 
447 aa  130  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  29.88 
 
 
445 aa  126  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  29.78 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  31.46 
 
 
489 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  29.85 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  26.89 
 
 
440 aa  106  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  26.36 
 
 
443 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  30.43 
 
 
445 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  26.22 
 
 
419 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  27.23 
 
 
438 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.43 
 
 
424 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.64 
 
 
430 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.43 
 
 
447 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.06 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  27.52 
 
 
481 aa  87  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.18 
 
 
425 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.19 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.45 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.99 
 
 
254 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  25.65 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  26.54 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  25.75 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  25 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  27.76 
 
 
307 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  25.3 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.05 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.49 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.51 
 
 
261 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.24 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  27.45 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  28.71 
 
 
447 aa  63.9  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  27.32 
 
 
336 aa  63.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  29.13 
 
 
348 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0492  ferric reductase  21.56 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.673317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.29 
 
 
335 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0440223  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4089  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.7 
 
 
340 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.39 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.06 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4622  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.57 
 
 
363 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  25.73 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4554  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.34 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.67 
 
 
337 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0185  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  26.79 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  26.79 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.54 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1358  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  26.79 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1554  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  26.79 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2727  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  26.79 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  26.79 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0213  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  26.79 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821344  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  25.66 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  27.13 
 
 
350 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.29 
 
 
368 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4810  ferredoxin  31.06 
 
 
330 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  21.08 
 
 
232 aa  53.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  32.99 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1948  putative flavodoxin reductase  30.59 
 
 
221 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.175846  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  23.08 
 
 
348 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2723  anthranilate dioxygenase reductase  29.35 
 
 
340 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484044  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  25.94 
 
 
338 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  25 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  22.82 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.98 
 
 
702 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.19 
 
 
232 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.45 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54409  ferric reductase  27.95 
 
 
746 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  22.78 
 
 
752 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6193  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.31 
 
 
342 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0211684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  25.85 
 
 
585 aa  50.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  26.19 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  22.55 
 
 
365 aa  50.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  25.45 
 
 
382 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.45 
 
 
382 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  25.95 
 
 
321 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.27 
 
 
740 aa  49.7  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  25.81 
 
 
386 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.44 
 
 
469 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2721  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit  26.77 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  25 
 
 
339 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.75 
 
 
245 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>