More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1926 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  100 
 
 
446 aa  889    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  63.33 
 
 
446 aa  551  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  62.42 
 
 
443 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  58.31 
 
 
447 aa  481  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  57.87 
 
 
447 aa  477  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  62.3 
 
 
446 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  55.21 
 
 
447 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  54.77 
 
 
447 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  51.2 
 
 
444 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  50.84 
 
 
445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  52.97 
 
 
445 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  48.8 
 
 
464 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  46.31 
 
 
443 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  50.72 
 
 
444 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  43.78 
 
 
442 aa  293  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  37.56 
 
 
440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  41.01 
 
 
445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  40.61 
 
 
438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  42.09 
 
 
434 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  41.34 
 
 
438 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  41.34 
 
 
438 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  41.4 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  36.34 
 
 
443 aa  269  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  35.1 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  35.44 
 
 
460 aa  224  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  38.25 
 
 
489 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  32.73 
 
 
424 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.22 
 
 
419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.98 
 
 
419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
419 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  25 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.44 
 
 
430 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  26.96 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.48 
 
 
448 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.63 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
678 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.08 
 
 
444 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  32.68 
 
 
321 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  32 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  25.68 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.22 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.31 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.25 
 
 
678 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  25.99 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.43 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  26.73 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  31.4 
 
 
678 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  26.41 
 
 
360 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  27.66 
 
 
662 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  30.56 
 
 
316 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  25.58 
 
 
481 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.84 
 
 
681 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  26.6 
 
 
605 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  28.97 
 
 
316 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  28.97 
 
 
321 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.28 
 
 
456 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  26.88 
 
 
605 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.81 
 
 
676 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.94 
 
 
232 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.75 
 
 
412 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  28.28 
 
 
321 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.64 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  30.92 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.1 
 
 
684 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  30.92 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24 
 
 
740 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2487  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.22 
 
 
369 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141396  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  25.55 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  32.73 
 
 
401 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.16 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  27.08 
 
 
691 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  30.77 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  22.55 
 
 
348 aa  60.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.04 
 
 
691 aa  60.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.96 
 
 
342 aa  60.1  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.39 
 
 
407 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.68 
 
 
368 aa  60.1  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2477  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.57 
 
 
367 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  30 
 
 
321 aa  60.1  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  30.26 
 
 
321 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  30.92 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  30.26 
 
 
321 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  30.92 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.96 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.97 
 
 
254 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4089  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.81 
 
 
340 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  30.26 
 
 
321 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  27.64 
 
 
363 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  30.92 
 
 
321 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  25.47 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  22.35 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  25.79 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.14 
 
 
684 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.87 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  28.28 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.79 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  28.21 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  28.33 
 
 
350 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.01 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1122  oxidoreductase  28.64 
 
 
340 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14183  normal  0.242287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>