More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_07070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  95.41 
 
 
434 aa  771    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  864    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  51.58 
 
 
442 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  46.01 
 
 
445 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  46.36 
 
 
438 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  46.36 
 
 
438 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  41.59 
 
 
444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  44.71 
 
 
460 aa  295  8e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  42.72 
 
 
446 aa  290  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.18 
 
 
443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  40.29 
 
 
445 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  43.26 
 
 
446 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  40.47 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  45.43 
 
 
489 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  42.09 
 
 
446 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  40.81 
 
 
444 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  40.8 
 
 
447 aa  277  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  40.58 
 
 
447 aa  276  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  39.16 
 
 
447 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  38.94 
 
 
447 aa  270  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  40.43 
 
 
438 aa  260  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  36.02 
 
 
441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  36.59 
 
 
443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  35.7 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  35.36 
 
 
440 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  36.34 
 
 
443 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  33.11 
 
 
424 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.47 
 
 
419 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.87 
 
 
419 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  28.83 
 
 
419 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  24.87 
 
 
419 aa  122  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.45 
 
 
494 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.99 
 
 
425 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.63 
 
 
430 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  31.87 
 
 
420 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  26.15 
 
 
450 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  27.06 
 
 
445 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.2 
 
 
421 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.91 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.19 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.12 
 
 
344 aa  84  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.49 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.86 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.15 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  28.66 
 
 
496 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.53 
 
 
465 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.22 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  27.95 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.95 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  30.86 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  36 
 
 
1138 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0492  ferric reductase  22.17 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.673317  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.51 
 
 
448 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.07 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.71 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.38 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  23.38 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  26.03 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  27.72 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  27.23 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.21 
 
 
469 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.07 
 
 
699 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1359  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  24.59 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000150243  hitchhiker  0.00000955183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.97 
 
 
232 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  28.71 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  27.93 
 
 
586 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.06 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  27.72 
 
 
605 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  26.42 
 
 
368 aa  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.09 
 
 
358 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  29.8 
 
 
447 aa  63.2  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  24.83 
 
 
481 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.2 
 
 
358 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.65 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.62 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  29.91 
 
 
581 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  28.95 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  27.84 
 
 
381 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  28.99 
 
 
322 aa  62.4  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  28.95 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  32.43 
 
 
586 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.8 
 
 
342 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  27.8 
 
 
360 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.38 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.73 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26490  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.72 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.365765  normal  0.166146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  26.6 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.91 
 
 
585 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.53 
 
 
367 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.57 
 
 
356 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.95 
 
 
321 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  31.94 
 
 
316 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.95 
 
 
321 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.57 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.95 
 
 
321 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2459  ferredoxin  35.53 
 
 
317 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0241293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.95 
 
 
321 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.57 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4884  6,7-dihydropteridine reductase  30.16 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  28.95 
 
 
321 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>