More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2459 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2459  ferredoxin  100 
 
 
317 aa  632  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0241293  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  47.54 
 
 
327 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  44.59 
 
 
326 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  41.05 
 
 
322 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  42.53 
 
 
323 aa  215  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  40.94 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  40.75 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  42.11 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  40.68 
 
 
319 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  40.37 
 
 
321 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  40.51 
 
 
316 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  41.25 
 
 
323 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  42.95 
 
 
322 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  39.37 
 
 
316 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  39.37 
 
 
316 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  41.16 
 
 
321 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  40.5 
 
 
321 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  42.53 
 
 
319 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.06 
 
 
318 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  38.8 
 
 
316 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  38.8 
 
 
316 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  38.8 
 
 
316 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.64 
 
 
317 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.06 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  41.78 
 
 
320 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.94 
 
 
315 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  39.18 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.12 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  39.18 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  39.18 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  39.18 
 
 
321 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.17 
 
 
315 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  40.48 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  39.18 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.87 
 
 
321 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  37.7 
 
 
322 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  41.58 
 
 
318 aa  195  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  39.18 
 
 
321 aa  195  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.38 
 
 
317 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  36.02 
 
 
322 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  37.54 
 
 
320 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  37.54 
 
 
320 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  38.6 
 
 
321 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  43.41 
 
 
784 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  43.41 
 
 
784 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  40.25 
 
 
318 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  38.17 
 
 
317 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  43.09 
 
 
784 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  43.09 
 
 
784 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  43.09 
 
 
784 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  43.09 
 
 
784 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  43.09 
 
 
784 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.87 
 
 
321 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  38.61 
 
 
321 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  37.93 
 
 
321 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  39.13 
 
 
319 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.24 
 
 
321 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.24 
 
 
322 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  41.8 
 
 
783 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  37.93 
 
 
321 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  35.67 
 
 
333 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  35.67 
 
 
333 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  37.93 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  36.34 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.17 
 
 
783 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  36.51 
 
 
322 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  36.92 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  36.96 
 
 
321 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  36.96 
 
 
321 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  40.62 
 
 
309 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  37.67 
 
 
315 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  37.95 
 
 
321 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  38.73 
 
 
784 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  35.42 
 
 
318 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  39.33 
 
 
352 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  40.06 
 
 
331 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  39.76 
 
 
324 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  36.51 
 
 
317 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.71 
 
 
321 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  37.78 
 
 
351 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  39.29 
 
 
325 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  39.3 
 
 
782 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  39.16 
 
 
330 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  37.5 
 
 
334 aa  185  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  37.54 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  37.65 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  40.63 
 
 
794 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  37.96 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  37.19 
 
 
333 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  39.21 
 
 
326 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  39.21 
 
 
326 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  38.17 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  39 
 
 
788 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.06 
 
 
317 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  36.92 
 
 
332 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  38.11 
 
 
326 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  34.16 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  38.66 
 
 
323 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  38.74 
 
 
788 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  35.71 
 
 
319 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>