More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6146 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  100 
 
 
450 aa  902    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50.44 
 
 
453 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  51.52 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.42 
 
 
448 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  40.77 
 
 
481 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  42.93 
 
 
447 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.79 
 
 
469 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  36.1 
 
 
496 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  35.97 
 
 
481 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  27.18 
 
 
447 aa  137  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.41 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.28 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  30.41 
 
 
420 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  32.2 
 
 
625 aa  100  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.51 
 
 
375 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.51 
 
 
669 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  31.71 
 
 
362 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.91 
 
 
421 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.56 
 
 
699 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.51 
 
 
375 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.63 
 
 
381 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  32.67 
 
 
443 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.37 
 
 
494 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  34.02 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  31.15 
 
 
372 aa  91.3  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.67 
 
 
443 aa  90.9  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.86 
 
 
406 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 
387 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  33.05 
 
 
597 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  31.02 
 
 
372 aa  89.7  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  25.91 
 
 
434 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.68 
 
 
691 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  32.89 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  30.08 
 
 
627 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.95 
 
 
421 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  34.45 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.86 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.25 
 
 
444 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  34.45 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  28.81 
 
 
366 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.62 
 
 
444 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  26.15 
 
 
434 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  27.62 
 
 
445 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  29.8 
 
 
355 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.38 
 
 
702 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  28.76 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.27 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.33 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  30.83 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.23 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.21 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.81 
 
 
430 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  28.08 
 
 
381 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  33.85 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.45 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  32.37 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.13 
 
 
465 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  31.58 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  25.99 
 
 
232 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  33.16 
 
 
464 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  32.16 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.05 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  30.92 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  27.43 
 
 
368 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.66 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.2 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  28.32 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.86 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.99 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  32.66 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.97 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.35 
 
 
678 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.29 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  27.97 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.69 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  27.97 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.12 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.95 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.05 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.46 
 
 
375 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.23 
 
 
681 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  29 
 
 
353 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  26.86 
 
 
348 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.57 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.2 
 
 
382 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.22 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  30.38 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.8 
 
 
675 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1329  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.25 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  29.83 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  29.31 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  29.13 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>