More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0392 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
469 aa  935    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.41 
 
 
448 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.19 
 
 
453 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.86 
 
 
456 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
481 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  37.38 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  40.54 
 
 
447 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  34.63 
 
 
496 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  32.21 
 
 
481 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  29.75 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.63 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.19 
 
 
447 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  25.42 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  30.15 
 
 
444 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.63 
 
 
254 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  31.13 
 
 
232 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  31.31 
 
 
464 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.14 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  30.17 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  28.71 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  28.49 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  28.49 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.87 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.94 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  28.21 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.44 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.44 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  29.8 
 
 
446 aa  77  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.88 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.73 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.88 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  27.55 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  32.89 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  26.91 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  26.37 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.5 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.94 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  31.22 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  30.24 
 
 
446 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  28.22 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  28.22 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  22.67 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  27.17 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  27.87 
 
 
676 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.34 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  28.57 
 
 
625 aa  69.7  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.44 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.92 
 
 
465 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.96 
 
 
261 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  29.87 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  29.81 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.63 
 
 
681 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.33 
 
 
669 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.16 
 
 
494 aa  67.8  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  40.78 
 
 
489 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  27.18 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.96 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.65 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  31.18 
 
 
382 aa  67  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  27.23 
 
 
674 aa  67  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.65 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.07 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  26.34 
 
 
394 aa  67  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.07 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.98 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.52 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.98 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  26.87 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  30.51 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  30.65 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.98 
 
 
380 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  30.98 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  31.52 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  32.61 
 
 
379 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  31.52 
 
 
382 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.98 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.52 
 
 
382 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  25.74 
 
 
460 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  28.08 
 
 
438 aa  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  25 
 
 
366 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  29.91 
 
 
395 aa  63.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.49 
 
 
702 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  25.97 
 
 
425 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.77 
 
 
368 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.25 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.43 
 
 
381 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.43 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.43 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.43 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  29.7 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.4 
 
 
232 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  27.13 
 
 
385 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  25 
 
 
366 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  27.47 
 
 
422 aa  61.6  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.85 
 
 
363 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.57 
 
 
385 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  23.54 
 
 
440 aa  61.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  25.42 
 
 
379 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>