More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1362 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 
430 aa  847    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.1 
 
 
419 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  34.22 
 
 
421 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  30.86 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  30.07 
 
 
447 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.93 
 
 
443 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  29.74 
 
 
447 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  27.84 
 
 
441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  31.95 
 
 
420 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.96 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  28.5 
 
 
442 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.01 
 
 
447 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.51 
 
 
424 aa  110  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
443 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  29.22 
 
 
443 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  29.06 
 
 
438 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  29.06 
 
 
438 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  28.64 
 
 
444 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  31.08 
 
 
464 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  29.77 
 
 
445 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  28.54 
 
 
444 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.03 
 
 
445 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.22 
 
 
448 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  28.44 
 
 
440 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.81 
 
 
446 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  29.47 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  28 
 
 
425 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  27.63 
 
 
434 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  24.58 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  30.19 
 
 
438 aa  94.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.74 
 
 
465 aa  94  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.37 
 
 
419 aa  94  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.95 
 
 
447 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  29.55 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.16 
 
 
456 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  29.3 
 
 
450 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  34.33 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.11 
 
 
254 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.09 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.08 
 
 
691 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  31.82 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  28.41 
 
 
460 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  28.23 
 
 
481 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.96 
 
 
676 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  28.12 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.5 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  27.46 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.02 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  33.7 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  33.33 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  33.33 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  26.35 
 
 
496 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  33.33 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.73 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  28.74 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3391  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.09 
 
 
242 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00300696  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.15 
 
 
681 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  33.16 
 
 
678 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.8 
 
 
699 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.76 
 
 
585 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.16 
 
 
678 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.94 
 
 
675 aa  77  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.41 
 
 
678 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.83 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  29.17 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.69 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  28.75 
 
 
402 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  27.71 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.14 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.14 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.14 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.14 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  29.92 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.29 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.96 
 
 
740 aa  74.3  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  30.14 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.14 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.14 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.56 
 
 
677 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.97 
 
 
688 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.85 
 
 
690 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  29.11 
 
 
627 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  28.51 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  29.3 
 
 
355 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.06 
 
 
494 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  26.51 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.73 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  28.7 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  28.77 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  29.79 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.81 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  26.82 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  27.4 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  24.9 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.4 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  26.8 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.44 
 
 
669 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  24.77 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>