More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3123 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  100 
 
 		 445 aa  894    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  79.1 
 
 		 444 aa  711    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  75.06 
 
 		 464 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  77.3 
 
 		 444 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  50 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  49.28 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  49.34 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  47.42 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  47.19 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 447 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  45.16 
 
 		 447 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  46.19 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  45.32 
 
 		 445 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  41.96 
 
 		 445 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  37.33 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  41.54 
 
 		 438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  41.54 
 
 		 438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.57 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  40.29 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  36.47 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  39.95 
 
 		 434 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  39.1 
 
 		 438 aa  269  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  33.94 
 
 		 440 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  35.36 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  37.55 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  29.93 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  33.25 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.22 
 
 		 419 aa  152  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.69 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  26.83 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  27.66 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.23 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  34.02 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.7 
 
 		 447 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.45 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.82 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.09 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.26 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  33 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.1 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.22 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  26.46 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.46 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  30 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.19 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.99 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.44 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.13 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.9 
 
 		 678 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.8 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.2 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.54 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  25.65 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  29.9 
 
 		 678 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  27.36 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.02 
 
 		 681 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.22 
 
 		 676 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  27.94 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.3 
 
 		 361 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  25.62 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.41 
 
 		 678 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  29.05 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  32.39 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.33 
 
 		 675 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.67 
 
 		 669 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  26.07 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  27.32 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.78 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  24.62 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  26.8 
 
 		 605 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.23 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  25.44 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.97 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  26.63 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  31.58 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0951  propane monoxygenase reductase  23.62 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  25.44 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.05 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  29.05 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  26.67 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  26.87 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  26.17 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  29.05 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  29.05 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  28.71 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.43 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  26.48 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4862  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.86 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350242  normal  0.072998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  24.64 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  29.05 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  31.21 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  28.38 
 
 		 321 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  27.43 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  24.76 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  28.57 
 
 		 691 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  27.56 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4810  ferredoxin  30.07 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  27.96 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>