More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2942 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  100 
 
 
444 aa  894    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  79.1 
 
 
445 aa  709    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  76.13 
 
 
464 aa  692    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  76.58 
 
 
444 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  54.11 
 
 
443 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  52.77 
 
 
446 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  51.2 
 
 
446 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  46.19 
 
 
447 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  46.19 
 
 
447 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  45.62 
 
 
447 aa  356  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  45.39 
 
 
447 aa  354  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  44.87 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  44.15 
 
 
445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  41.11 
 
 
434 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  41.01 
 
 
434 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  45.06 
 
 
445 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.6 
 
 
442 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  40.05 
 
 
438 aa  279  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  40.05 
 
 
438 aa  279  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  36.26 
 
 
443 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  36.79 
 
 
441 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  38.17 
 
 
443 aa  270  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  38.66 
 
 
438 aa  262  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  34.7 
 
 
440 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  39.35 
 
 
460 aa  242  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  40.05 
 
 
489 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  30.96 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.18 
 
 
419 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  32.24 
 
 
419 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.74 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  25.7 
 
 
419 aa  100  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  26.4 
 
 
445 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.25 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  26.67 
 
 
447 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.3 
 
 
421 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.34 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.6 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  33.85 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.5 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.63 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.86 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.57 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.07 
 
 
669 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.65 
 
 
678 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  26.39 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.37 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  26.64 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.77 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  30.11 
 
 
678 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.15 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.46 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  24.75 
 
 
232 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4862  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.64 
 
 
354 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350242  normal  0.072998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  29.17 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.67 
 
 
676 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  28.7 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.88 
 
 
681 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.71 
 
 
585 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  30.1 
 
 
625 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.34 
 
 
456 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.54 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  26.44 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.83 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.23 
 
 
678 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.63 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4176  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.8 
 
 
220 aa  65.1  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.09 
 
 
342 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.47 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  24.63 
 
 
481 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  24.27 
 
 
375 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  29.49 
 
 
321 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  29.49 
 
 
316 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  23.72 
 
 
496 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  25.71 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  28.85 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.07 
 
 
322 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.88 
 
 
675 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  24.84 
 
 
322 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  25.11 
 
 
307 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.82 
 
 
254 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0140  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  24.03 
 
 
357 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.347043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.34 
 
 
702 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  23.68 
 
 
350 aa  61.6  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  26.37 
 
 
334 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  25.59 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.84 
 
 
374 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.7 
 
 
363 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.88 
 
 
383 aa  60.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  27.78 
 
 
691 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4810  ferredoxin  26.8 
 
 
330 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  20 
 
 
740 aa  60.5  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.13 
 
 
688 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24 
 
 
232 aa  59.7  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.73 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.28 
 
 
325 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  29.05 
 
 
317 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  31.62 
 
 
379 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.94 
 
 
690 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  28.77 
 
 
317 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  25.85 
 
 
585 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>