More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6591 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  74.73 
 
 
448 aa  669    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  100 
 
 
481 aa  933    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.28 
 
 
456 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.58 
 
 
453 aa  345  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  44.08 
 
 
450 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  45.37 
 
 
447 aa  294  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.22 
 
 
469 aa  270  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  37.88 
 
 
496 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  38.42 
 
 
481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  29 
 
 
447 aa  134  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.99 
 
 
447 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  29.07 
 
 
445 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  27.94 
 
 
445 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.59 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.28 
 
 
444 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  29.61 
 
 
365 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  31.2 
 
 
381 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  28.1 
 
 
447 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  28.1 
 
 
447 aa  87  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.33 
 
 
406 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  26.33 
 
 
443 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.17 
 
 
494 aa  85.9  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.9 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.76 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.76 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.47 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.76 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.71 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.36 
 
 
465 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  33.33 
 
 
444 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  30.52 
 
 
662 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.94 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  34.15 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  29.37 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.37 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  29.76 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.37 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  31.02 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.47 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.37 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.49 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.46 
 
 
669 aa  80.9  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.4 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  29.24 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  29.09 
 
 
325 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.98 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  27.48 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.87 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  31.22 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.74 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  28.74 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.74 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  28.97 
 
 
605 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.36 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.29 
 
 
380 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.92 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.34 
 
 
381 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  26.05 
 
 
232 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  32.39 
 
 
395 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.69 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.67 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  27.49 
 
 
355 aa  76.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.34 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.34 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.34 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  29.13 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  27.2 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.27 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  29.5 
 
 
625 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.46 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  28.79 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.29 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  24.29 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  30.09 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.12 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.75 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  28.74 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  25.51 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  27.05 
 
 
627 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  26 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  29.35 
 
 
447 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.52 
 
 
372 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
681 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  31.98 
 
 
446 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0569  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.97 
 
 
281 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  31.51 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.7 
 
 
272 aa  72.4  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00198507  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  28.63 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.22 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.93 
 
 
232 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  25.59 
 
 
368 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  29.04 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  26.8 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3690  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.92 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  26 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.92 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  29.02 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  27.08 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>