More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5577 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
261 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  66.8 
 
 
250 aa  315  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2269  oxidoreductase FAD-binding subunit  66.14 
 
 
252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  64.2 
 
 
255 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  57.32 
 
 
243 aa  285  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4092  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  58.24 
 
 
269 aa  271  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3261  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  60 
 
 
244 aa  255  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  53.91 
 
 
248 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0922  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.98 
 
 
247 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0121  oxidoreductase FAD-binding region  37.82 
 
 
248 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2080  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.22 
 
 
239 aa  161  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1056  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.86 
 
 
264 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2402  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.93 
 
 
243 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2125  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.51 
 
 
243 aa  158  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0605  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.02 
 
 
242 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.5 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53.9 
 
 
168 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.202422  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0109  oxidoreductase FAD-binding region  41.63 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.6 
 
 
251 aa  123  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4471  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.92 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3398  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.41 
 
 
259 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2611  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.57 
 
 
198 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.77 
 
 
383 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.98 
 
 
402 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  26.61 
 
 
373 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.04 
 
 
375 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  35.22 
 
 
379 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.89 
 
 
368 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.79 
 
 
585 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.96 
 
 
338 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.28 
 
 
702 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.48 
 
 
375 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.94 
 
 
352 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 
381 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.92 
 
 
335 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0440223  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.91 
 
 
338 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  31.91 
 
 
338 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.48 
 
 
353 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  31.98 
 
 
402 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.74 
 
 
699 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  30.38 
 
 
402 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  30.99 
 
 
339 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  33.95 
 
 
605 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  32 
 
 
605 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.77 
 
 
402 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  31.76 
 
 
356 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  30.92 
 
 
402 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.27 
 
 
681 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  30.92 
 
 
399 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  30.92 
 
 
402 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  32.47 
 
 
881 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  30.04 
 
 
597 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  31.58 
 
 
402 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.47 
 
 
881 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.22 
 
 
341 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.09 
 
 
337 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  30.33 
 
 
336 aa  96.3  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.89 
 
 
848 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.47 
 
 
881 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  30.36 
 
 
402 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32 
 
 
336 aa  95.5  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.32 
 
 
700 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  31.06 
 
 
365 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  35.85 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  30.53 
 
 
402 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.17 
 
 
402 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  30.53 
 
 
402 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  30.53 
 
 
402 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  30.53 
 
 
402 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  30.42 
 
 
366 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  29.79 
 
 
585 aa  93.6  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4160  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
962 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.312376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.17 
 
 
329 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.62 
 
 
375 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  29.96 
 
 
402 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.27 
 
 
337 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.88 
 
 
367 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  32.55 
 
 
419 aa  92.4  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.92 
 
 
350 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  31.58 
 
 
408 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  32.38 
 
 
352 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.72 
 
 
358 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.54 
 
 
669 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  33.94 
 
 
366 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.17 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.4 
 
 
752 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30 
 
 
366 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  31.12 
 
 
339 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  31.08 
 
 
339 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  30.58 
 
 
366 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  31.12 
 
 
366 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  31.08 
 
 
339 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.87 
 
 
348 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  31.12 
 
 
366 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.17 
 
 
339 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.96 
 
 
358 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  27.92 
 
 
339 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  29.71 
 
 
670 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.15 
 
 
690 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02792  phenol hydroxylase  33.33 
 
 
235 aa  89  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>