More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5181 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 
234 aa  460  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4471  oxidoreductase FAD-binding subunit  86.32 
 
 
233 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2080  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  63.09 
 
 
239 aa  266  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2402  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  61.37 
 
 
243 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2125  oxidoreductase FAD-binding subunit  60.94 
 
 
243 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3398  oxidoreductase FAD-binding subunit  63.04 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0121  oxidoreductase FAD-binding region  48.54 
 
 
248 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50.62 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0922  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.21 
 
 
247 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0109  oxidoreductase FAD-binding region  50.93 
 
 
216 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  50.41 
 
 
250 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  42.44 
 
 
243 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.5 
 
 
261 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.5 
 
 
255 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1056  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.29 
 
 
264 aa  144  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2269  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.68 
 
 
252 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4092  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.41 
 
 
269 aa  138  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3261  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.88 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2611  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.5 
 
 
198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0605  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.44 
 
 
242 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.36 
 
 
251 aa  115  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.37 
 
 
699 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.15 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.17 
 
 
752 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.02 
 
 
367 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.42 
 
 
669 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  27.85 
 
 
585 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  29.69 
 
 
327 aa  99  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  27.97 
 
 
373 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.27 
 
 
344 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53.98 
 
 
168 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.202422  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1354  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.62 
 
 
360 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1656  ferredoxin/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  31.62 
 
 
342 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  30.43 
 
 
368 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4410  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.75 
 
 
376 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.12 
 
 
365 aa  96.3  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.93 
 
 
351 aa  95.5  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.61 
 
 
396 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.51 
 
 
366 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.51 
 
 
368 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  29.74 
 
 
341 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.45 
 
 
363 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.05 
 
 
352 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  31.22 
 
 
393 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.82 
 
 
367 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2466  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.18 
 
 
394 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00689943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  32.18 
 
 
625 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.64 
 
 
390 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.51 
 
 
366 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  27.16 
 
 
366 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.06 
 
 
346 aa  92  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.14 
 
 
687 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.57 
 
 
585 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.63 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  30.3 
 
 
356 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.85 
 
 
368 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0410  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.67 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  26.72 
 
 
366 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.51 
 
 
353 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.14 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  29.79 
 
 
382 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.79 
 
 
382 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.17 
 
 
347 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.79 
 
 
382 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.79 
 
 
382 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  29.41 
 
 
597 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  28.38 
 
 
366 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  29.06 
 
 
662 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  28.38 
 
 
366 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.23 
 
 
357 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.93 
 
 
322 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.93 
 
 
322 aa  89  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  27.95 
 
 
366 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  29.79 
 
 
382 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.51 
 
 
356 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2280  phenol hydrolase reductase  30.94 
 
 
352 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.25 
 
 
399 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0140  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  32.77 
 
 
357 aa  88.6  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.347043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.63 
 
 
354 aa  88.6  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.04 
 
 
681 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  26.02 
 
 
349 aa  88.2  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.93 
 
 
322 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  34.93 
 
 
322 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.93 
 
 
322 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  28 
 
 
365 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  28.15 
 
 
362 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.93 
 
 
322 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.49 
 
 
382 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  30.77 
 
 
361 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  34.93 
 
 
322 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.49 
 
 
382 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.93 
 
 
322 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.23 
 
 
398 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.13 
 
 
352 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.48 
 
 
354 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.93 
 
 
322 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.02 
 
 
365 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  27.32 
 
 
605 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  28.07 
 
 
377 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.51 
 
 
385 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>