More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0935 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 
251 aa  503  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.19 
 
 
248 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  35.86 
 
 
243 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0922  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.27 
 
 
247 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0121  oxidoreductase FAD-binding region  33.75 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  35.86 
 
 
250 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.45 
 
 
702 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.6 
 
 
261 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2080  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.71 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  29.83 
 
 
585 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2269  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.44 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2125  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2402  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 
243 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  34.15 
 
 
346 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.63 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  33.88 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.22 
 
 
366 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.22 
 
 
366 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  30.34 
 
 
353 aa  111  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4092  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.49 
 
 
354 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.7 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.71 
 
 
669 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  29.63 
 
 
366 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.36 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  30.3 
 
 
394 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.95 
 
 
688 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  29.22 
 
 
366 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.32 
 
 
353 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.22 
 
 
366 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.4 
 
 
390 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  32.27 
 
 
353 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  29 
 
 
606 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  29 
 
 
606 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  31.22 
 
 
356 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.15 
 
 
677 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  29.11 
 
 
597 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.08 
 
 
340 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.27 
 
 
367 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  28.09 
 
 
627 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.45 
 
 
389 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.71 
 
 
353 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.22 
 
 
352 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.91 
 
 
354 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  28.94 
 
 
670 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.03 
 
 
348 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  29.74 
 
 
232 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  29.25 
 
 
625 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1068  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.91 
 
 
384 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.570837  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.02 
 
 
341 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  28.39 
 
 
338 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.39 
 
 
338 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.82 
 
 
676 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  30.8 
 
 
371 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  30.38 
 
 
352 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.4 
 
 
346 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0109  oxidoreductase FAD-binding region  37.71 
 
 
216 aa  99.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  28.4 
 
 
366 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  28.4 
 
 
366 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.63 
 
 
397 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10390  hypothetical protein  32.78 
 
 
425 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0586534  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.16 
 
 
363 aa  99.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  27.16 
 
 
357 aa  99.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.77 
 
 
347 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1799  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.92 
 
 
336 aa  99  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.29 
 
 
354 aa  99  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.63 
 
 
337 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.45 
 
 
352 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  29.33 
 
 
605 aa  98.6  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.24 
 
 
360 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.66 
 
 
365 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0470  oxidoreductase FAD-binding region  29.44 
 
 
388 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.950503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0457  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.44 
 
 
388 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0481  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.44 
 
 
388 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  31.43 
 
 
379 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.03 
 
 
362 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1091  ferredoxin oxidoreductase protein  28.88 
 
 
328 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5717  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.92 
 
 
369 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.25 
 
 
364 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.25 
 
 
364 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.9 
 
 
699 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.7 
 
 
752 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.2 
 
 
341 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.09 
 
 
354 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.23 
 
 
362 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.09 
 
 
354 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4410  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.13 
 
 
376 aa  95.5  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  33.33 
 
 
360 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32110  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer component  31.91 
 
 
337 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.18 
 
 
585 aa  95.9  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1284  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.68 
 
 
298 aa  95.9  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.723981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  33.33 
 
 
360 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0410  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.46 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.63 
 
 
368 aa  95.5  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  28.81 
 
 
361 aa  95.1  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.13 
 
 
232 aa  95.1  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  28.76 
 
 
418 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.68 
 
 
406 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  26.69 
 
 
368 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  25.3 
 
 
365 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>