More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1284 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1284  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
298 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.723981  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0139  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.55 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136816  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5279  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.81 
 
 
362 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4173  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.86 
 
 
271 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.0667321 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1463  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.14 
 
 
266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  34.56 
 
 
248 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  34.93 
 
 
248 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001139  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.52 
 
 
254 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.35 
 
 
258 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  31.93 
 
 
258 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4802  ferredoxin-NADP reductase  34.33 
 
 
248 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  34 
 
 
258 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  34.63 
 
 
248 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  35.19 
 
 
248 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  34 
 
 
258 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  34 
 
 
258 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0433  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.2 
 
 
258 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  34.56 
 
 
248 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  34.56 
 
 
248 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  34.56 
 
 
248 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0055  ferredoxin-NADP reductase  32.48 
 
 
250 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.2 
 
 
263 aa  99.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.62 
 
 
246 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  33.48 
 
 
258 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3545  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.05 
 
 
276 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247053  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06648  ferredoxin-NADP reductase  31.67 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.51 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.37 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  33.63 
 
 
248 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0729  oxidoreductase FAD-binding region  33.62 
 
 
258 aa  95.9  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56849  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  34.53 
 
 
248 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  33.63 
 
 
248 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.68 
 
 
251 aa  95.9  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  33.63 
 
 
248 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3199  ferredoxin--NADP reductase  32.64 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  33.18 
 
 
248 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  33.18 
 
 
248 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1614  ferredoxin--NADP reductase  32.64 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2499  ferredoxin--NADP reductase  32.64 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.729092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  33.18 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  33.18 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2640  ferredoxin--NADP reductase  32.64 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  33.18 
 
 
248 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  33.18 
 
 
248 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2116  ferredoxin--NADP reductase  32.64 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1389  ferredoxin--NADP reductase  32.64 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.270211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2553  ferredoxin--NADP reductase  32.64 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.43 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  33.18 
 
 
248 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.3 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.74 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.15 
 
 
257 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  32.74 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1764  ferredoxin--NADP(+) reductase  34.26 
 
 
256 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.53 
 
 
257 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  32.74 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0488  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.65 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1536  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.89 
 
 
258 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.02359e-24  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.02 
 
 
278 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  32.02 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.92 
 
 
372 aa  92.8  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1120  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.87 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.15 
 
 
257 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.15 
 
 
333 aa  92.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.06 
 
 
257 aa  92  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2358  ferredoxin-NADP reductase  32.88 
 
 
248 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.4 
 
 
258 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2736  ferredoxin--NADP(+) reductase  30.59 
 
 
257 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192379  normal  0.0156387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2331  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.01 
 
 
257 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237211  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3868  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.81 
 
 
258 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  normal  0.341668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  31.88 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2610  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.01 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0435  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.92 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.124338  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.53 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4204  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.12 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0128  oxidoreductase FAD-binding protein  32.62 
 
 
258 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  29.08 
 
 
260 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.98 
 
 
246 aa  89.7  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2964  ferredoxin--NADP(+) reductase  30.38 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3098  ferredoxin--NADP(+) reductase  30.38 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0530  ferredoxin--NADP+ reductase  29.08 
 
 
257 aa  89  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0754774  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.27 
 
 
253 aa  89.4  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4207  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32 
 
 
257 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0415  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.5 
 
 
248 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.74 
 
 
246 aa  89  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  34.33 
 
 
881 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.33 
 
 
881 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6401  ferredoxin--NADP(+) reductase  30.8 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.99 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1804  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.68 
 
 
257 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  hitchhiker  0.00241273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1477  ferredoxin NADP+ reductase  32.7 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.33 
 
 
881 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1733  ferredoxin--NADP+ reductase  32.1 
 
 
258 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3050  ferredoxin--NADP(+) reductase  30.83 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38470  NADPH: ferredoxin reductase  32.51 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1677  ferredoxin--NADP(+) reductase  28.46 
 
 
257 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3072  ferredoxin--NADP(+) reductase  30.38 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1897  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0319142  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20140  ferredoxin--NADP+ reductase  31.69 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.96585 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3053  ferredoxin--NADP(+) reductase  30.38 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>