More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0415 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0415  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 
248 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0635  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50.6 
 
 
249 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.34 
 
 
246 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3230  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.79 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.59 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.262229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  47.79 
 
 
249 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.332833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  47.39 
 
 
260 aa  231  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0943  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.99 
 
 
249 aa  231  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.432314  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  49.4 
 
 
249 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0809  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.39 
 
 
249 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0747  ferredoxin--NADP reductase  48.19 
 
 
249 aa  230  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3696  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.39 
 
 
249 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0068232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3820  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.39 
 
 
249 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  45.45 
 
 
253 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3350  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  49 
 
 
249 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3520  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.79 
 
 
249 aa  228  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  222  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0993  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.34 
 
 
246 aa  221  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  221  9e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  44.18 
 
 
248 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.18 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.08 
 
 
263 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4802  ferredoxin-NADP reductase  43.37 
 
 
248 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.63 
 
 
246 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  42.57 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  42.57 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  42.57 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  42.57 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  41.77 
 
 
248 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  41.77 
 
 
248 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  41.77 
 
 
248 aa  210  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  41.77 
 
 
248 aa  209  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.13 
 
 
246 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001139  ferredoxin--NADP(+) reductase  44.31 
 
 
254 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  40.96 
 
 
248 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1677  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.24 
 
 
257 aa  196  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  40.51 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06648  ferredoxin-NADP reductase  41.87 
 
 
254 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.08 
 
 
258 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2201  ferredoxin--NADP reductase  39.43 
 
 
257 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  39.66 
 
 
258 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  42.15 
 
 
258 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.4 
 
 
258 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.74 
 
 
258 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  38.82 
 
 
258 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.55 
 
 
278 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.13 
 
 
258 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.29 
 
 
258 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.13 
 
 
284 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.36 
 
 
274 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0279177  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.96 
 
 
276 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  33.96 
 
 
276 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1293  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.55 
 
 
275 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.55 
 
 
259 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  0.185245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4079  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.55 
 
 
259 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20140  ferredoxin--NADP+ reductase  33.07 
 
 
258 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.96585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.55 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4021  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.55 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1733  ferredoxin--NADP+ reductase  32.68 
 
 
258 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3050  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.95 
 
 
256 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.15 
 
 
259 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.690302  hitchhiker  0.00000000358553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1764  ferredoxin--NADP(+) reductase  33.61 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.15 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2331  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.44 
 
 
257 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237211  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2610  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.44 
 
 
257 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1856  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.37 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1804  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.85 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  hitchhiker  0.00241273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0128  oxidoreductase FAD-binding protein  33.33 
 
 
258 aa  144  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0245  putative ferredoxin--NADP reductase  32.03 
 
 
256 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3292  ferredoxin--NADP reductase  32.03 
 
 
256 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3388  ferredoxin--NADP reductase  32.03 
 
 
256 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2130  ferredoxin--NADP reductase  32.03 
 
 
256 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0427  ferredoxin--NADP reductase  32.28 
 
 
271 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0233  putative ferredoxin--NADP reductase  32.03 
 
 
256 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125844  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0211  ferredoxin--NADP reductase  32.28 
 
 
271 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.29 
 
 
257 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2958  ferredoxin--NADP reductase  32.03 
 
 
256 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0729  oxidoreductase FAD-binding region  34.17 
 
 
258 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56849  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4207  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.42 
 
 
257 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4024  ferredoxin--NADP reductase  32.69 
 
 
259 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1387  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.69 
 
 
259 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7072  ferredoxin--NADP(+) reductase  31.4 
 
 
256 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4204  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.44 
 
 
257 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.44 
 
 
257 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.02 
 
 
257 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4345  ferredoxin--NADP reductase  32.38 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3545  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.4 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247053  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6401  ferredoxin--NADP(+) reductase  30.86 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2964  ferredoxin--NADP(+) reductase  31.4 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3098  ferredoxin--NADP(+) reductase  31.4 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>