More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0843 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.262229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0943  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  69.08 
 
 
249 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.432314  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3230  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  67.07 
 
 
249 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0747  ferredoxin--NADP reductase  66.67 
 
 
249 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3350  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  65.86 
 
 
249 aa  348  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  65.86 
 
 
249 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3696  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  66.27 
 
 
249 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0068232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  66.27 
 
 
249 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.332833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3820  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  66.27 
 
 
249 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0809  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  66.27 
 
 
249 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3520  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  64.66 
 
 
249 aa  343  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0635  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  65.86 
 
 
249 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  64.26 
 
 
246 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  65.06 
 
 
260 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0993  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  61.85 
 
 
246 aa  329  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  55.51 
 
 
253 aa  299  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.35 
 
 
246 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0415  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  46.59 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.94 
 
 
263 aa  228  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.94 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.97 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  42.97 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  215  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  43.37 
 
 
248 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  215  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  42.57 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  42.57 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  42.57 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  42.57 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4802  ferredoxin-NADP reductase  42.17 
 
 
248 aa  211  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  42.57 
 
 
248 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  41.37 
 
 
248 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  41.37 
 
 
248 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  41.37 
 
 
248 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  38.96 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  38.96 
 
 
248 aa  198  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.83 
 
 
258 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.66 
 
 
258 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.25 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.72 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0279177  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1677  ferredoxin--NADP(+) reductase  38.74 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.66 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.25 
 
 
278 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  40.66 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001139  ferredoxin--NADP(+) reductase  43.5 
 
 
254 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.58 
 
 
258 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.73 
 
 
258 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2201  ferredoxin--NADP reductase  38.98 
 
 
257 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  40.25 
 
 
258 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06648  ferredoxin-NADP reductase  42.91 
 
 
254 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  39.6 
 
 
258 aa  174  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  40.66 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.19 
 
 
276 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  35.19 
 
 
276 aa  169  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.06 
 
 
270 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.25 
 
 
259 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  0.185245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4079  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.25 
 
 
259 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.25 
 
 
259 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.690302  hitchhiker  0.00000000358553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1293  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.25 
 
 
275 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.47 
 
 
259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4021  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.86 
 
 
259 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0268  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.15 
 
 
257 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4024  ferredoxin--NADP reductase  36.08 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1387  ferredoxin--NADP(+) reductase  35.69 
 
 
259 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0177  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.88 
 
 
257 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0729  oxidoreductase FAD-binding region  37.71 
 
 
258 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56849  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38470  NADPH: ferredoxin reductase  37.25 
 
 
258 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0171  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.41 
 
 
257 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.057325  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  36.11 
 
 
258 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  36.61 
 
 
258 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.8 
 
 
257 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4070  ferredoxin--NADP(+) reductase  36.08 
 
 
257 aa  148  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112548  normal  0.136075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0153  ferredoxin--NADP(+) reductase  34.63 
 
 
257 aa  148  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0852  ferredoxin--NADP(+) reductase  34.63 
 
 
257 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.58 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1614  ferredoxin--NADP reductase  35.71 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2499  ferredoxin--NADP reductase  35.71 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.729092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3199  ferredoxin--NADP reductase  35.71 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2640  ferredoxin--NADP reductase  35.71 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4207  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.61 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2116  ferredoxin--NADP reductase  35.71 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2553  ferredoxin--NADP reductase  35.71 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1389  ferredoxin--NADP reductase  35.71 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.270211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0128  oxidoreductase FAD-binding protein  34.39 
 
 
258 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2681  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.8 
 
 
258 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.756214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20140  ferredoxin--NADP+ reductase  36.47 
 
 
258 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.96585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1916  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.22 
 
 
257 aa  145  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179638  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.24 
 
 
257 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1535  ferredoxin--NADP(+) reductase  36.67 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00112997  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0887  putative NAD(P)/FAD ferrodoxin  36.25 
 
 
257 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000860446  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1733  ferredoxin--NADP+ reductase  36.08 
 
 
258 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1180  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.65 
 
 
258 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal  0.236184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>