More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4888 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  82.17 
 
 
258 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  83.33 
 
 
258 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  81.78 
 
 
258 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  80.62 
 
 
258 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  79.07 
 
 
284 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  78.68 
 
 
258 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  78.68 
 
 
258 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  77.91 
 
 
278 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  70.54 
 
 
258 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  66.67 
 
 
258 aa  355  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  50 
 
 
270 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.64 
 
 
274 aa  249  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0279177  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  46.57 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  46.93 
 
 
276 aa  239  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  44.31 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  44.31 
 
 
258 aa  218  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.61 
 
 
246 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0433  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.49 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4207  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.1 
 
 
257 aa  211  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.53 
 
 
263 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.88 
 
 
257 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.92 
 
 
257 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2736  ferredoxin--NADP(+) reductase  43.43 
 
 
257 aa  204  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192379  normal  0.0156387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2331  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.15 
 
 
257 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237211  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0435  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.46 
 
 
292 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.124338  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2610  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.15 
 
 
257 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0224  ferredoxin--NADP(+) reductase  42.63 
 
 
257 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0997  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.48 
 
 
257 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.9 
 
 
259 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.690302  hitchhiker  0.00000000358553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.57 
 
 
257 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.35 
 
 
257 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0084  ferredoxin--NADP(+) reductase  42.23 
 
 
258 aa  201  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.5 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  0.185245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1764  ferredoxin--NADP(+) reductase  42.97 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4079  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.5 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0153  ferredoxin--NADP(+) reductase  42.23 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1804  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.99 
 
 
257 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  hitchhiker  0.00241273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.5 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4070  ferredoxin--NADP(+) reductase  43.43 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112548  normal  0.136075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0171  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.63 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.057325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  43.95 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4021  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.5 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4024  ferredoxin--NADP reductase  41.5 
 
 
259 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1387  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.5 
 
 
259 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4204  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.73 
 
 
257 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  42.91 
 
 
248 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1856  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.35 
 
 
256 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0099  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.86 
 
 
256 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1293  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.57 
 
 
275 aa  198  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.53 
 
 
257 aa  198  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1305  ferredoxin--NADP reductase  43.33 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0376  Ferredoxin--NADP(+) reductase  43.25 
 
 
256 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3545  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.48 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247053  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0993  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.02 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0852  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.43 
 
 
257 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0658  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.06 
 
 
258 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0112179  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2150  ferredoxin NADP+ reductase  43.55 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0323789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0268  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.43 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  42.51 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0530  ferredoxin--NADP+ reductase  42.4 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0754774  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1180  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.08 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal  0.236184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0635  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.66 
 
 
249 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1241  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.08 
 
 
258 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070109  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3868  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.33 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  normal  0.341668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0128  oxidoreductase FAD-binding protein  42.29 
 
 
258 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  45.09 
 
 
248 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1092  ferredoxin---NADP reductase  41.87 
 
 
276 aa  192  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.364906  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1242  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.23 
 
 
257 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0342  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.23 
 
 
275 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.24356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  43.85 
 
 
248 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3050  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.67 
 
 
256 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2659  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.18 
 
 
259 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0420108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.76 
 
 
246 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  40.89 
 
 
248 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1479  ferredoxin--NADP(+) reductase  42.98 
 
 
258 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0427  ferredoxin--NADP reductase  41.47 
 
 
271 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4345  ferredoxin--NADP reductase  42.06 
 
 
256 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0482  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.33 
 
 
258 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.40301  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.44 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  43.44 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  43.44 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  42.45 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20140  ferredoxin--NADP+ reductase  41.77 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.96585 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0233  putative ferredoxin--NADP reductase  42.06 
 
 
256 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2958  ferredoxin--NADP reductase  42.06 
 
 
256 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3292  ferredoxin--NADP reductase  42.06 
 
 
256 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0245  putative ferredoxin--NADP reductase  42.06 
 
 
256 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2130  ferredoxin--NADP reductase  42.06 
 
 
256 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3388  ferredoxin--NADP reductase  42.06 
 
 
256 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0943  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.76 
 
 
249 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.432314  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0729  oxidoreductase FAD-binding region  42.92 
 
 
258 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56849  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0177  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.43 
 
 
257 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>