More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0858 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  64.26 
 
 
249 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.262229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0943  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  64.26 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.432314  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  63.45 
 
 
249 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.332833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3820  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  63.05 
 
 
249 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3230  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  62.25 
 
 
249 aa  330  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0809  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  63.05 
 
 
249 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0747  ferredoxin--NADP reductase  62.25 
 
 
249 aa  329  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3696  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  62.65 
 
 
249 aa  328  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0068232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0993  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  61.38 
 
 
246 aa  328  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0635  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  62.25 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3520  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  61.85 
 
 
249 aa  324  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3350  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  62.25 
 
 
249 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  62.25 
 
 
249 aa  322  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  59.84 
 
 
260 aa  310  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  58.1 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.9 
 
 
246 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.08 
 
 
263 aa  240  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0415  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  46.34 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.12 
 
 
246 aa  234  8e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  45.12 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  43.5 
 
 
248 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  43.5 
 
 
248 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  43.5 
 
 
248 aa  228  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.5 
 
 
248 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  43.9 
 
 
248 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  43.5 
 
 
248 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  43.5 
 
 
248 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  43.5 
 
 
248 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  43.5 
 
 
248 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  43.09 
 
 
248 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  43.09 
 
 
248 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  42.68 
 
 
248 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  42.68 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  42.68 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  42.28 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4802  ferredoxin-NADP reductase  42.68 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  41.46 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  41.46 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  41.46 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  43.09 
 
 
247 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  39.02 
 
 
248 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  39.02 
 
 
248 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001139  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.63 
 
 
254 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  41.67 
 
 
258 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.76 
 
 
258 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1677  ferredoxin--NADP(+) reductase  38.37 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.91 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.76 
 
 
258 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  40.49 
 
 
258 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.76 
 
 
258 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.76 
 
 
284 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.34 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2201  ferredoxin--NADP reductase  39.18 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06648  ferredoxin-NADP reductase  39.43 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.66 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  39.5 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  39.5 
 
 
258 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.21 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0279177  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.84 
 
 
276 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.84 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4207  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.11 
 
 
257 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  34.52 
 
 
258 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  34.52 
 
 
258 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2659  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.18 
 
 
259 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0420108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.65 
 
 
270 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.97 
 
 
259 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  0.185245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4079  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.97 
 
 
259 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1293  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.61 
 
 
275 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.14 
 
 
257 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4021  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.4 
 
 
259 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2358  ferredoxin-NADP reductase  36.05 
 
 
248 aa  148  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3545  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.65 
 
 
276 aa  148  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247053  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0957  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.95 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.846112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0268  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.41 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.690302  hitchhiker  0.00000000358553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1076  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.95 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1536  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.45 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.02359e-24  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4024  ferredoxin--NADP reductase  35.6 
 
 
259 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1387  ferredoxin--NADP(+) reductase  35.6 
 
 
259 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3199  ferredoxin--NADP reductase  34.44 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1614  ferredoxin--NADP reductase  34.44 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2116  ferredoxin--NADP reductase  34.44 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2553  ferredoxin--NADP reductase  34.44 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2640  ferredoxin--NADP reductase  34.44 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2499  ferredoxin--NADP reductase  34.44 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.729092  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1242  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.74 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1389  ferredoxin--NADP reductase  34.44 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.270211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0488  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.59 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0435  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.92 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.124338  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1856  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.75 
 
 
256 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186168  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0433  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.94 
 
 
258 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.46 
 
 
257 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.07 
 
 
257 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2681  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.03 
 
 
258 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.756214  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0482  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.4 
 
 
258 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.40301  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.28 
 
 
257 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0055  ferredoxin-NADP reductase  34.69 
 
 
250 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1764  ferredoxin--NADP(+) reductase  33.2 
 
 
256 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>