More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0792 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  94.57 
 
 
258 aa  503  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  94.57 
 
 
284 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  93.8 
 
 
278 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  82.17 
 
 
258 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  82.17 
 
 
258 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  78.68 
 
 
258 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  76.36 
 
 
258 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  75.19 
 
 
258 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  74.03 
 
 
258 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  68.22 
 
 
258 aa  359  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  51.16 
 
 
270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.74 
 
 
274 aa  240  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0279177  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  46.86 
 
 
276 aa  228  6e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  46.13 
 
 
276 aa  226  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  42.35 
 
 
258 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  42.52 
 
 
258 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.49 
 
 
246 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0433  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.52 
 
 
258 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.82 
 
 
257 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  43.95 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  44.26 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0435  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.31 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.124338  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  44.26 
 
 
248 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1764  ferredoxin--NADP(+) reductase  44.18 
 
 
256 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  41.7 
 
 
248 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  44.17 
 
 
248 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  41.7 
 
 
248 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  41.7 
 
 
248 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0993  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.5 
 
 
246 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2331  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.26 
 
 
257 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237211  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.34 
 
 
257 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2610  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.64 
 
 
257 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.9 
 
 
259 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  41.3 
 
 
248 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.06 
 
 
257 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.9 
 
 
259 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  0.185245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0153  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.64 
 
 
257 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  42.26 
 
 
263 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0171  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.04 
 
 
257 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.057325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4207  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.96 
 
 
257 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4079  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.9 
 
 
259 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4024  ferredoxin--NADP reductase  41.9 
 
 
259 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1387  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.9 
 
 
259 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  40.49 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0530  ferredoxin--NADP+ reductase  42.17 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0754774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.9 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.690302  hitchhiker  0.00000000358553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4021  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.9 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  42.39 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  42.62 
 
 
248 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  41.3 
 
 
247 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1804  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.49 
 
 
257 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  hitchhiker  0.00241273 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.96 
 
 
257 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  42.62 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  42.62 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  42.62 
 
 
248 aa  188  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  42.62 
 
 
248 aa  188  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  42.62 
 
 
248 aa  188  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.21 
 
 
248 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  42.21 
 
 
248 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.64 
 
 
257 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  42.21 
 
 
248 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0084  ferredoxin--NADP(+) reductase  39.04 
 
 
258 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016059  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4204  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.35 
 
 
257 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0635  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 
249 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1293  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.46 
 
 
275 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0376  Ferredoxin--NADP(+) reductase  42.86 
 
 
256 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.68 
 
 
246 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1856  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.92 
 
 
256 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4802  ferredoxin-NADP reductase  40.83 
 
 
248 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2736  ferredoxin--NADP(+) reductase  39.84 
 
 
257 aa  185  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192379  normal  0.0156387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2659  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.06 
 
 
259 aa  185  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0420108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0342  ferredoxin--NADP(+) reductase  38.7 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.24356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.66 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3545  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.29 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247053  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0224  ferredoxin--NADP(+) reductase  39.84 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0099  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.74 
 
 
256 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1242  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.16 
 
 
257 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0128  oxidoreductase FAD-binding protein  41.57 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20140  ferredoxin--NADP+ reductase  41.37 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.96585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4345  ferredoxin--NADP reductase  41.67 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0997  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.71 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1733  ferredoxin--NADP+ reductase  40.96 
 
 
258 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0211  ferredoxin--NADP reductase  40.7 
 
 
271 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0658  ferredoxin--NADP(+) reductase  39.11 
 
 
258 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0112179  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1305  ferredoxin--NADP reductase  41.67 
 
 
258 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0747  ferredoxin--NADP reductase  40.83 
 
 
249 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.58 
 
 
249 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.262229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2964  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.87 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3098  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.87 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2681  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.46 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.756214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0427  ferredoxin--NADP reductase  40.7 
 
 
271 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1479  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.74 
 
 
258 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4070  ferredoxin--NADP(+) reductase  39.04 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112548  normal  0.136075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0943  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.92 
 
 
249 aa  178  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.432314  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3292  ferredoxin--NADP reductase  41.27 
 
 
256 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38470  NADPH: ferredoxin reductase  40.16 
 
 
258 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>