More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0943 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0943  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
249 aa  508  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.432314  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0993  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  70.28 
 
 
246 aa  371  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  69.08 
 
 
249 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.262229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3230  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  66.67 
 
 
249 aa  360  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0635  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  65.86 
 
 
249 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0747  ferredoxin--NADP reductase  65.06 
 
 
249 aa  350  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3520  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  65.06 
 
 
249 aa  349  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3350  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  64.66 
 
 
249 aa  348  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  64.66 
 
 
249 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3696  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  63.45 
 
 
249 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0068232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  63.45 
 
 
249 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.332833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0809  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  63.45 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3820  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  63.45 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  64.26 
 
 
246 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  62.25 
 
 
260 aa  327  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  58.66 
 
 
253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  47.98 
 
 
246 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  47.18 
 
 
246 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.35 
 
 
263 aa  238  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  44.98 
 
 
247 aa  232  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  44.18 
 
 
248 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0415  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  46.99 
 
 
248 aa  231  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.18 
 
 
248 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  44.58 
 
 
248 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  231  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  44.58 
 
 
248 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  44.58 
 
 
248 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4802  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  43.78 
 
 
248 aa  228  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  42.17 
 
 
248 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  39.36 
 
 
248 aa  209  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  39.76 
 
 
248 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1677  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.5 
 
 
257 aa  202  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2201  ferredoxin--NADP reductase  41.73 
 
 
257 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06648  ferredoxin-NADP reductase  42.11 
 
 
254 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.5 
 
 
258 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.76 
 
 
258 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  40 
 
 
258 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  40.33 
 
 
258 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001139  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.73 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.42 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.59 
 
 
278 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  39 
 
 
258 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.16 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  39 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.92 
 
 
258 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.93 
 
 
274 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0279177  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.44 
 
 
276 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  35.19 
 
 
276 aa  161  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.56 
 
 
270 aa  148  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2358  ferredoxin-NADP reductase  36.44 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0852  ferredoxin--NADP(+) reductase  34.11 
 
 
257 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  35.89 
 
 
258 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  35.89 
 
 
258 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.69 
 
 
257 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0084  ferredoxin--NADP(+) reductase  36.18 
 
 
258 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.59 
 
 
257 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0171  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.11 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.057325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0488  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.2 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0153  ferredoxin--NADP(+) reductase  33.72 
 
 
257 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4207  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.82 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.51 
 
 
257 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.68 
 
 
257 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0433  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.87 
 
 
258 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0729  oxidoreductase FAD-binding region  35.59 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56849  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0268  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.69 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1242  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.75 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3545  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.27 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247053  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2681  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.59 
 
 
258 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.756214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0997  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.93 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0128  oxidoreductase FAD-binding protein  31.89 
 
 
258 aa  131  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3199  ferredoxin--NADP reductase  32.81 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1614  ferredoxin--NADP reductase  32.81 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2736  ferredoxin--NADP(+) reductase  31.76 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192379  normal  0.0156387 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2499  ferredoxin--NADP reductase  32.81 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.729092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2640  ferredoxin--NADP reductase  32.81 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1389  ferredoxin--NADP reductase  32.81 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.270211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2553  ferredoxin--NADP reductase  32.81 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4070  ferredoxin--NADP(+) reductase  31.76 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112548  normal  0.136075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3050  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.66 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2116  ferredoxin--NADP reductase  32.81 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2659  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.27 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0420108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1804  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.47 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  hitchhiker  0.00241273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0224  ferredoxin--NADP(+) reductase  33.59 
 
 
257 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0177  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.91 
 
 
257 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1856  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.32 
 
 
256 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186168  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4024  ferredoxin--NADP reductase  35.02 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1916  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.76 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179638  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>