More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1686 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0279177  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  79.64 
 
 
276 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  78.18 
 
 
276 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.64 
 
 
258 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.65 
 
 
258 aa  248  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  48.5 
 
 
284 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  48.3 
 
 
278 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.3 
 
 
258 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  49.63 
 
 
258 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.74 
 
 
258 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  48.12 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  47.12 
 
 
258 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  46.72 
 
 
258 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  46.76 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.61 
 
 
270 aa  208  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.72 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.262229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  39.03 
 
 
248 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  39.03 
 
 
248 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4802  ferredoxin-NADP reductase  38.41 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  37.84 
 
 
248 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  39.78 
 
 
248 aa  178  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  37.84 
 
 
248 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.95 
 
 
246 aa  178  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  37.84 
 
 
248 aa  178  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3820  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.59 
 
 
249 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3696  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.59 
 
 
249 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0068232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0809  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.59 
 
 
249 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  38.66 
 
 
248 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.22 
 
 
249 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.332833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3230  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.08 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2331  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.04 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237211  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0433  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.44 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2610  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.04 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.67 
 
 
249 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.64 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.84 
 
 
248 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0747  ferredoxin--NADP reductase  36.67 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  37.84 
 
 
248 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  37.31 
 
 
260 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  37.84 
 
 
248 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0943  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.93 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.432314  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  38.22 
 
 
248 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  37.84 
 
 
248 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  37.84 
 
 
248 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  37.84 
 
 
248 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  37.92 
 
 
247 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  37.84 
 
 
248 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  37.84 
 
 
248 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3350  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.3 
 
 
249 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3868  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.52 
 
 
258 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  normal  0.341668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0099  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.7 
 
 
256 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4204  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.64 
 
 
257 aa  168  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1764  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.54 
 
 
256 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  40.68 
 
 
258 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.23 
 
 
263 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0993  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.71 
 
 
246 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805357 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06648  ferredoxin-NADP reductase  38.43 
 
 
254 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  40.68 
 
 
258 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1856  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.01 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0729  oxidoreductase FAD-binding region  40.89 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56849  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.21 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.55 
 
 
257 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4345  ferredoxin--NADP reductase  40.7 
 
 
256 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0415  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.36 
 
 
248 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3292  ferredoxin--NADP reductase  39.19 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0245  putative ferredoxin--NADP reductase  39.19 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3388  ferredoxin--NADP reductase  39.19 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0233  putative ferredoxin--NADP reductase  39.19 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2958  ferredoxin--NADP reductase  39.19 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2130  ferredoxin--NADP reductase  39.19 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0635  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.57 
 
 
249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.92 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3072  ferredoxin--NADP(+) reductase  39.26 
 
 
256 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2439  ferredoxin--NADP(+) reductase  39.26 
 
 
256 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3053  ferredoxin--NADP(+) reductase  39.26 
 
 
256 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0427  ferredoxin--NADP reductase  39.19 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  37.07 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  37.07 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  37.07 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0376  Ferredoxin--NADP(+) reductase  40.7 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  37.07 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  37.07 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.82 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3520  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.19 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1677  ferredoxin--NADP(+) reductase  36.43 
 
 
257 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0211  ferredoxin--NADP reductase  38.46 
 
 
271 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2964  ferredoxin--NADP(+) reductase  38.89 
 
 
256 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.36 
 
 
246 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3098  ferredoxin--NADP(+) reductase  38.89 
 
 
256 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20140  ferredoxin--NADP+ reductase  39.92 
 
 
258 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.96585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1733  ferredoxin--NADP+ reductase  39.92 
 
 
258 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3050  ferredoxin--NADP(+) reductase  38.89 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.13 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1387  ferredoxin--NADP(+) reductase  39.54 
 
 
259 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4021  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.08 
 
 
259 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1804  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.65 
 
 
257 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  hitchhiker  0.00241273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4024  ferredoxin--NADP reductase  39.54 
 
 
259 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4079  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.69 
 
 
259 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6401  ferredoxin--NADP(+) reductase  38.89 
 
 
256 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.08 
 
 
259 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.690302  hitchhiker  0.00000000358553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>