More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0635 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0635  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
249 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  71.49 
 
 
249 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3350  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  71.08 
 
 
249 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3520  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  71.08 
 
 
249 aa  364  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0747  ferredoxin--NADP reductase  69.88 
 
 
249 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0809  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  69.88 
 
 
249 aa  360  9e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3820  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  69.88 
 
 
249 aa  360  9e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  69.88 
 
 
249 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.332833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3696  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  69.48 
 
 
249 aa  358  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0068232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0943  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  65.86 
 
 
249 aa  354  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.432314  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3230  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  67.47 
 
 
249 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  64.4 
 
 
260 aa  339  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  65.86 
 
 
249 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.262229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  62.25 
 
 
246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0993  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  63.05 
 
 
246 aa  326  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  59.84 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  52.82 
 
 
246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0415  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  50.6 
 
 
248 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  47.18 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  46.77 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  45.38 
 
 
247 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  45.78 
 
 
248 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  45.78 
 
 
248 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  45.78 
 
 
248 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.78 
 
 
248 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  45.78 
 
 
248 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  45.78 
 
 
248 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  45.78 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  45.78 
 
 
248 aa  215  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  44.58 
 
 
248 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  45.78 
 
 
248 aa  215  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  44.58 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  44.18 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4802  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  42.97 
 
 
248 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1677  ferredoxin--NADP(+) reductase  43.08 
 
 
257 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  41.77 
 
 
248 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  41.77 
 
 
248 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  41.77 
 
 
248 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  40.96 
 
 
248 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  39.36 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2201  ferredoxin--NADP reductase  43.08 
 
 
257 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.66 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.74 
 
 
258 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.25 
 
 
278 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  41.49 
 
 
258 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  39.3 
 
 
258 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  41.49 
 
 
258 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.83 
 
 
258 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  42.63 
 
 
258 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.83 
 
 
284 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 
258 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.57 
 
 
258 aa  185  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06648  ferredoxin-NADP reductase  43.09 
 
 
254 aa  185  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001139  ferredoxin--NADP(+) reductase  43.09 
 
 
254 aa  178  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.8 
 
 
276 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.57 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0279177  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  34.8 
 
 
276 aa  161  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.89 
 
 
257 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.25 
 
 
270 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.7 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  35.69 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4070  ferredoxin--NADP(+) reductase  34.39 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112548  normal  0.136075 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  35.69 
 
 
258 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.43 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  0.185245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4079  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.43 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2736  ferredoxin--NADP(+) reductase  34.52 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192379  normal  0.0156387 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3050  ferredoxin--NADP(+) reductase  36.44 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4021  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.43 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2681  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.86 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.756214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0128  oxidoreductase FAD-binding protein  34.78 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2358  ferredoxin-NADP reductase  37.71 
 
 
248 aa  144  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.16 
 
 
259 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.690302  hitchhiker  0.00000000358553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1293  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.04 
 
 
275 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.04 
 
 
259 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0268  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.73 
 
 
257 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0435  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.6 
 
 
292 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.124338  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.11 
 
 
257 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3072  ferredoxin--NADP(+) reductase  33.98 
 
 
256 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2439  ferredoxin--NADP(+) reductase  33.98 
 
 
256 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3053  ferredoxin--NADP(+) reductase  33.98 
 
 
256 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4024  ferredoxin--NADP reductase  34.9 
 
 
259 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1387  ferredoxin--NADP(+) reductase  34.9 
 
 
259 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0488  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.77 
 
 
263 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0245  putative ferredoxin--NADP reductase  34.77 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3292  ferredoxin--NADP reductase  34.77 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2958  ferredoxin--NADP reductase  34.77 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3388  ferredoxin--NADP reductase  34.77 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2130  ferredoxin--NADP reductase  34.77 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0233  putative ferredoxin--NADP reductase  34.77 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0427  ferredoxin--NADP reductase  35.04 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20140  ferredoxin--NADP+ reductase  34.25 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.96585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0177  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.94 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 
257 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1916  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.25 
 
 
257 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179638  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0957  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.68 
 
 
259 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.846112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1076  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.68 
 
 
259 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>