More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4640 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  97.12 
 
 
284 aa  553  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  98.84 
 
 
258 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  93.8 
 
 
258 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  82.56 
 
 
258 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  82.56 
 
 
258 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  77.91 
 
 
258 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  75.97 
 
 
258 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  73.64 
 
 
258 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  72.48 
 
 
258 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  67.44 
 
 
258 aa  358  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  52.71 
 
 
270 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  48.3 
 
 
274 aa  242  5e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0279177  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.41 
 
 
276 aa  236  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  47.04 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.19 
 
 
246 aa  211  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  42.75 
 
 
258 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  42.75 
 
 
258 aa  205  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0433  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.91 
 
 
258 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0435  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.62 
 
 
292 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.124338  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  43.95 
 
 
248 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0530  ferredoxin--NADP+ reductase  44 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0754774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.82 
 
 
257 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  43.85 
 
 
260 aa  195  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0993  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.86 
 
 
246 aa  195  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.84 
 
 
263 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.92 
 
 
257 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2331  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.68 
 
 
257 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237211  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  44.26 
 
 
248 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.34 
 
 
257 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  44.26 
 
 
248 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2610  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.06 
 
 
257 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1804  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.92 
 
 
257 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  hitchhiker  0.00241273 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  41.8 
 
 
248 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  41.8 
 
 
248 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  41.8 
 
 
248 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  43.85 
 
 
248 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0635  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.25 
 
 
249 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.9 
 
 
259 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  0.185245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4079  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.9 
 
 
259 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0171  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.43 
 
 
257 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.057325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4207  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.08 
 
 
257 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0153  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.04 
 
 
257 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1764  ferredoxin--NADP(+) reductase  43.78 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.9 
 
 
259 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1305  ferredoxin--NADP reductase  43.75 
 
 
258 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0224  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.04 
 
 
257 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  41.77 
 
 
248 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  45.09 
 
 
248 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4204  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.21 
 
 
257 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.9 
 
 
259 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.690302  hitchhiker  0.00000000358553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4021  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.9 
 
 
259 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0084  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.32 
 
 
258 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016059  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.29 
 
 
257 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4024  ferredoxin--NADP reductase  41.9 
 
 
259 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1387  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.9 
 
 
259 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.64 
 
 
257 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  41.3 
 
 
247 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0099  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.95 
 
 
256 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  40.49 
 
 
248 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0376  Ferredoxin--NADP(+) reductase  43.65 
 
 
256 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  42.62 
 
 
248 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0342  ferredoxin--NADP(+) reductase  38.69 
 
 
275 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.24356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2659  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.06 
 
 
259 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0420108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1856  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.92 
 
 
256 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  42.62 
 
 
248 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  42.62 
 
 
248 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  42.62 
 
 
248 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  42.62 
 
 
248 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  42.62 
 
 
248 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.68 
 
 
246 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2736  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.24 
 
 
257 aa  185  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192379  normal  0.0156387 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1479  ferredoxin--NADP(+) reductase  43.44 
 
 
258 aa  185  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0211  ferredoxin--NADP reductase  41.86 
 
 
271 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1293  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.7 
 
 
275 aa  185  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.34 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.21 
 
 
248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  42.21 
 
 
248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2439  ferredoxin--NADP(+) reductase  42.46 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3072  ferredoxin--NADP(+) reductase  42.46 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3053  ferredoxin--NADP(+) reductase  42.46 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  42.21 
 
 
248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0997  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.11 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1241  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.25 
 
 
258 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070109  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0128  oxidoreductase FAD-binding protein  41.57 
 
 
258 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0482  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.44 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.40301  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0427  ferredoxin--NADP reductase  41.6 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.25 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.262229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3545  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.38 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247053  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20140  ferredoxin--NADP+ reductase  41.37 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.96585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2150  ferredoxin NADP+ reductase  41.13 
 
 
270 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0323789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4070  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.24 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112548  normal  0.136075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4345  ferredoxin--NADP reductase  42.91 
 
 
256 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0747  ferredoxin--NADP reductase  39.61 
 
 
249 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0245  putative ferredoxin--NADP reductase  42.46 
 
 
256 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3292  ferredoxin--NADP reductase  42.46 
 
 
256 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3388  ferredoxin--NADP reductase  42.46 
 
 
256 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2958  ferredoxin--NADP reductase  42.46 
 
 
256 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>