More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1479 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1479  ferredoxin--NADP(+) reductase  100 
 
 
258 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0482  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  96.9 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.40301  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1305  ferredoxin--NADP reductase  74.03 
 
 
258 aa  410  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1241  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  73.64 
 
 
258 aa  410  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070109  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1180  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  73.26 
 
 
258 aa  407  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal  0.236184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2681  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  69.77 
 
 
258 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.756214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1536  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  69.77 
 
 
258 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.02359e-24  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1733  ferredoxin--NADP+ reductase  68.6 
 
 
258 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38470  NADPH: ferredoxin reductase  68.6 
 
 
258 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0729  oxidoreductase FAD-binding region  66.28 
 
 
258 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56849  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  68.34 
 
 
259 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.690302  hitchhiker  0.00000000358553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20140  ferredoxin--NADP+ reductase  68.22 
 
 
258 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.96585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4021  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  67.18 
 
 
259 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  67.18 
 
 
259 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  0.185245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4079  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  67.18 
 
 
259 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  67.18 
 
 
259 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0128  oxidoreductase FAD-binding protein  68.6 
 
 
258 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1293  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  66.02 
 
 
275 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3868  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  68.09 
 
 
258 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  normal  0.341668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4024  ferredoxin--NADP reductase  66.02 
 
 
259 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1387  ferredoxin--NADP(+) reductase  66.02 
 
 
259 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1614  ferredoxin--NADP reductase  64.73 
 
 
257 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2640  ferredoxin--NADP reductase  64.73 
 
 
257 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1389  ferredoxin--NADP reductase  64.73 
 
 
257 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.270211  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2116  ferredoxin--NADP reductase  64.73 
 
 
257 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2499  ferredoxin--NADP reductase  64.73 
 
 
257 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.729092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3199  ferredoxin--NADP reductase  64.73 
 
 
257 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2553  ferredoxin--NADP reductase  64.73 
 
 
257 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0224  ferredoxin--NADP(+) reductase  64.34 
 
 
257 aa  349  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4070  ferredoxin--NADP(+) reductase  63.18 
 
 
257 aa  345  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112548  normal  0.136075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0153  ferredoxin--NADP(+) reductase  65.12 
 
 
257 aa  345  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0887  putative NAD(P)/FAD ferrodoxin  64.06 
 
 
257 aa  343  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000860446  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0171  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  64.73 
 
 
257 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.057325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1856  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  63.95 
 
 
256 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3388  ferredoxin--NADP reductase  63.42 
 
 
256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3292  ferredoxin--NADP reductase  63.42 
 
 
256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0427  ferredoxin--NADP reductase  63.42 
 
 
271 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2958  ferredoxin--NADP reductase  63.42 
 
 
256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0233  putative ferredoxin--NADP reductase  63.42 
 
 
256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2130  ferredoxin--NADP reductase  63.42 
 
 
256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0245  putative ferredoxin--NADP reductase  63.42 
 
 
256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2659  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  61.87 
 
 
259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0420108 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00657  ferredoxin--NADP reductase  62.26 
 
 
259 aa  342  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.190082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1916  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  62.89 
 
 
257 aa  341  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179638  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  62.65 
 
 
258 aa  341  7e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0211  ferredoxin--NADP reductase  62.65 
 
 
271 aa  341  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1535  ferredoxin--NADP(+) reductase  63.28 
 
 
257 aa  341  9e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00112997  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0433  oxidoreductase FAD-binding subunit  62.65 
 
 
258 aa  340  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2736  ferredoxin--NADP(+) reductase  62.79 
 
 
257 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192379  normal  0.0156387 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  62.65 
 
 
258 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  61.24 
 
 
257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0852  ferredoxin--NADP(+) reductase  62.02 
 
 
257 aa  338  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0084  ferredoxin--NADP(+) reductase  63.32 
 
 
258 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0268  oxidoreductase FAD-binding subunit  62.02 
 
 
257 aa  338  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0997  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  62.79 
 
 
257 aa  337  9e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0177  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  61.24 
 
 
257 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  60.85 
 
 
257 aa  335  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  61.63 
 
 
257 aa  334  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2439  ferredoxin--NADP(+) reductase  61.09 
 
 
256 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3072  ferredoxin--NADP(+) reductase  61.09 
 
 
256 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3053  ferredoxin--NADP(+) reductase  61.09 
 
 
256 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3050  ferredoxin--NADP(+) reductase  62.26 
 
 
256 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2610  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  61.63 
 
 
257 aa  333  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2331  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  61.63 
 
 
257 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237211  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1804  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  60.85 
 
 
257 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  hitchhiker  0.00241273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4204  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  61.24 
 
 
257 aa  332  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0376  Ferredoxin--NADP(+) reductase  61.72 
 
 
256 aa  332  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2964  ferredoxin--NADP(+) reductase  60.7 
 
 
256 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6401  ferredoxin--NADP(+) reductase  60.7 
 
 
256 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3098  ferredoxin--NADP(+) reductase  60.7 
 
 
256 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4207  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  61.63 
 
 
257 aa  331  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1076  ferredoxin--NADP(+) reductase  60.94 
 
 
259 aa  331  8e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3545  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  60.85 
 
 
276 aa  331  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247053  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4345  ferredoxin--NADP reductase  61.72 
 
 
256 aa  331  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  60.47 
 
 
257 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0957  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  60.94 
 
 
259 aa  329  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.846112  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0658  ferredoxin--NADP(+) reductase  62.02 
 
 
258 aa  329  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0112179  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7072  ferredoxin--NADP(+) reductase  59.14 
 
 
256 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0099  oxidoreductase FAD-binding subunit  60.16 
 
 
256 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0435  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  59.84 
 
 
292 aa  320  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.124338  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1242  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  58.14 
 
 
257 aa  317  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1670  ferredoxin--NADP(+) reductase  58.14 
 
 
257 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133245  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1764  ferredoxin--NADP(+) reductase  58.2 
 
 
256 aa  314  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0530  ferredoxin--NADP+ reductase  57.36 
 
 
257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0754774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  55.81 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1713  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  58.04 
 
 
270 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1897  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  58.04 
 
 
270 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0319142  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1477  ferredoxin NADP+ reductase  60.08 
 
 
257 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2287  ferredoxin--NADP(+) reductase  54.17 
 
 
269 aa  295  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1766  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  57.75 
 
 
257 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2150  ferredoxin NADP+ reductase  57.2 
 
 
270 aa  290  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0323789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4445  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  55 
 
 
283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1103  oxidoreductase FAD-binding subunit  54.51 
 
 
270 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0342  ferredoxin--NADP(+) reductase  53.94 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.24356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0104  ferredoxin--NADP(+) reductase  52.55 
 
 
269 aa  271  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0658  ferredoxin--NADP(+) reductase  52.14 
 
 
278 aa  268  8.999999999999999e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0335  oxidoreductase FAD-binding subunit  51.38 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.024115  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1032  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  52.34 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.799175  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0590  ferredoxin--NADP(+) reductase  50.2 
 
 
268 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1939  NADPH-ferredoxin reductase  50.2 
 
 
268 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>