More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0109 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0109  oxidoreductase FAD-binding region  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0121  oxidoreductase FAD-binding region  79.63 
 
 
248 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.93 
 
 
234 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2080  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.61 
 
 
239 aa  181  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2402  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.15 
 
 
243 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2125  oxidoreductase FAD-binding subunit  48.15 
 
 
243 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0922  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.34 
 
 
247 aa  171  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3398  oxidoreductase FAD-binding subunit  50.95 
 
 
259 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  44.81 
 
 
243 aa  168  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4471  oxidoreductase FAD-binding subunit  51.4 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.76 
 
 
248 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  46.19 
 
 
250 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.43 
 
 
261 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2269  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.93 
 
 
252 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4092  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.27 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.4 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0605  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.58 
 
 
242 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3261  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.72 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1056  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.39 
 
 
264 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2611  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.19 
 
 
198 aa  121  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.16 
 
 
251 aa  111  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53.21 
 
 
168 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.202422  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  28.17 
 
 
373 aa  92  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0410  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.99 
 
 
239 aa  91.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  31.92 
 
 
368 aa  91.7  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0575  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.19 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.11 
 
 
699 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1656  ferredoxin/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  29.13 
 
 
342 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2602  hypothetical protein  29.44 
 
 
318 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1354  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.13 
 
 
360 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  28.5 
 
 
585 aa  85.5  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.84 
 
 
752 aa  85.1  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.25 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2458  hypothetical protein  28.7 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.24 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2508  oxygenase, putative  29.5 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663767  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.3 
 
 
367 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.32 
 
 
585 aa  81.6  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  34.25 
 
 
625 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.97 
 
 
669 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.91 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.11 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  32.47 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 
686 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.24 
 
 
375 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.94 
 
 
337 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.24 
 
 
381 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.44 
 
 
414 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  24.88 
 
 
350 aa  78.6  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.22 
 
 
687 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  33 
 
 
606 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  33 
 
 
606 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.99 
 
 
681 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0140  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  29.27 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.347043 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.58 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2702  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.26 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.26 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.58 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.76 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  33.51 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.26 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.44 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.5 
 
 
702 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  30.32 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.32 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  33.77 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.32 
 
 
380 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.22 
 
 
467 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  29.91 
 
 
597 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.11 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2756  ferredoxin  27.01 
 
 
339 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.624393  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  33.11 
 
 
382 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.11 
 
 
382 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  28.7 
 
 
670 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.84 
 
 
366 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.45 
 
 
382 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.8 
 
 
675 aa  74.7  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.68 
 
 
346 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.83 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.86 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.04 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  32.45 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  34.44 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.86 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  27.83 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  28.25 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.86 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.86 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.66 
 
 
677 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  29.28 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3690  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.31 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4880  ferredoxin  24.76 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0508  ferredoxin  24.41 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.303507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.58 
 
 
848 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  30.92 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.45 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.45 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5717  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.58 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  29.69 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.45 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>