157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1980 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 
183 aa  378  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  60.44 
 
 
185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.49 
 
 
212 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  43.43 
 
 
171 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  50.42 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  50.42 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.06 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  41.11 
 
 
180 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.11 
 
 
177 aa  111  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.07 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  39.73 
 
 
208 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  51.82 
 
 
191 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  38.86 
 
 
184 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.12 
 
 
172 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  45.13 
 
 
182 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.35 
 
 
179 aa  101  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  41.22 
 
 
203 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.13 
 
 
183 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  36.41 
 
 
169 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  45.24 
 
 
156 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.62 
 
 
189 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  36.42 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  42.31 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  43.8 
 
 
192 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  44.25 
 
 
183 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.44 
 
 
172 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.14 
 
 
165 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.41 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  38 
 
 
185 aa  98.6  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.21 
 
 
190 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  40.4 
 
 
175 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  36.96 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.47 
 
 
239 aa  95.5  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.33 
 
 
171 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  35.16 
 
 
510 aa  94.4  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.79 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  34.78 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  42.15 
 
 
180 aa  89  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.94 
 
 
171 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  41.94 
 
 
171 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  41.13 
 
 
154 aa  87.8  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.86 
 
 
172 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  40.94 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28559  predicted protein  38.93 
 
 
197 aa  86.3  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000859292  hitchhiker  0.000000574282 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.69 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.27 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.69 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  39.46 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  40 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  40.94 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89018  Superoxide dismutase (Cu-Zn)  41.18 
 
 
154 aa  85.5  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.204777  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.69 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.69 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.69 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.69 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.69 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.03 
 
 
165 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.67 
 
 
173 aa  84.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.85 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  37.41 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.03 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.03 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  33.81 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  39.34 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.36 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  36.57 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.99 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.73 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  33.73 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  30.69 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.84 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.15 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.61 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.53 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  35.53 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  30.37 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  30.73 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  34.87 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  35.76 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.53 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  32.93 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.06 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.44 
 
 
171 aa  72  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.3 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.9 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  29.79 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.76 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1018  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.71 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0356333  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  32.91 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  30.51 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3479  putative copper/zinc superoxide dismutase  33.14 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.1 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.8 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  39.16 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.6 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  31.33 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  31.33 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.88 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  31.33 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>