121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1018 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1018  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 
177 aa  359  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0356333  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3479  putative copper/zinc superoxide dismutase  98.31 
 
 
177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2188  superoxide dismutase copper/zinc binding  80.79 
 
 
206 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0161821  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0859  superoxide dismutase, Cu-Zn  71.27 
 
 
216 aa  248  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1214  superoxide dismutase, Cu-Zn  70.72 
 
 
179 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1056  copper/zinc superoxide dismutase  70.72 
 
 
179 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1062  copper/zinc superoxide dismutase  70.72 
 
 
179 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0713  superoxide dismutase, Cu-Zn  70.17 
 
 
179 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2300  superoxide dismutase, Cu-Zn  70.17 
 
 
179 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2986  superoxide dismutase, Cu-Zn  70.17 
 
 
179 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1613  superoxide dismutase, Cu-Zn  70.17 
 
 
179 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0860  superoxide dismutase copper/zinc binding  77.48 
 
 
178 aa  245  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0340028  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1823  superoxide dismutase, copper/zinc binding  77.48 
 
 
178 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2434  superoxide dismutase, copper/zinc binding  77.48 
 
 
178 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2439  superoxide dismutase copper/zinc binding  77.48 
 
 
178 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305746  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5765  copper/Zinc superoxide dismutase  76.82 
 
 
178 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212202  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2481  superoxide dismutase, copper/zinc binding  75.5 
 
 
178 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2347  superoxide dismutase copper/zinc binding  75.5 
 
 
178 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.21 
 
 
177 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  39.57 
 
 
180 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  36.75 
 
 
171 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  39.58 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.89 
 
 
212 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.97 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.97 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  39.01 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.04 
 
 
206 aa  86.3  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.55 
 
 
180 aa  84.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  35.92 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.06 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.64 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.74 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  36.36 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.37 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  31.41 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.51 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  39.07 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  31.33 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.5 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.86 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.19 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.19 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.19 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.19 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.19 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  27.95 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.85 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.95 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  33.79 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.75 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.33 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  28.16 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.33 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.22 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  28.65 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.97 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  32.67 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.97 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.71 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89018  Superoxide dismutase (Cu-Zn)  34.31 
 
 
154 aa  55.1  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.204777  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.06 
 
 
171 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.09 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  30.22 
 
 
154 aa  54.3  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.58 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.23 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.82 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.82 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  32.84 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.11 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.32 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  30.99 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  30.99 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  30.99 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.84 
 
 
169 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  30.99 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  30.99 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  30.99 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  30 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.61 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  27.27 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  30.99 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  29.79 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  30.28 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  28.37 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  28.37 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  28.37 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  25.48 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  27.59 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  22.09 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  27.59 
 
 
173 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  26.29 
 
 
179 aa  47.8  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.08 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.08 
 
 
162 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  30.15 
 
 
154 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  29.58 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  27.59 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  27.59 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  27.59 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  30.71 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  27.91 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>